Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PUF60Q9UHX1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PUF60Q9UHX1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PUF60Q9UHX1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PUF60Q9UHX1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PUF60Q9UHX1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PUF60Q9UHX1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PUF60Q9UHX1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PUF60Q9UHX1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PUF60Q9UHX1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PUF60Q9UHX1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PUF60Q9UHX1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PUF60Q9UHX1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PUF60Q9UHX1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PUF60Q9UHX1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PUF60Q9UHX1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PUF60Q9UHX1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PUF60Q9UHX1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PUF60Q9UHX1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PUF60Q9UHX1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PUF60Q9UHX1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PUF60Q9UHX1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PUF60Q9UHX1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PUF60Q9UHX1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PUF60Q9UHX1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PUF60Q9UHX1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PUF60Q9UHX1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PUF60Q9UHX1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PUF60Q9UHX1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PUF60Q9UHX1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PUF60Q9UHX1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PUF60Q9UHX1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PUF60Q9UHX1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PUF60Q9UHX1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PUF60Q9UHX1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PUF60Q9UHX1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PUF60Q9UHX1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PUF60Q9UHX1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PUF60Q9UHX1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PUF60Q9UHX1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PUF60Q9UHX1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PUF60Q9UHX1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PUF60Q9UHX1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PUF60Q9UHX1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PUF60Q9UHX1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PUF60Q9UHX1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PUF60Q9UHX1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PUF60Q9UHX1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PUF60Q9UHX1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PUF60Q9UHX1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PUF60Q9UHX1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PUF60Q9UHX1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PUF60Q9UHX1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PUF60Q9UHX1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PUF60Q9UHX1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PUF60Q9UHX1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PUF60Q9UHX1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PUF60Q9UHX1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PUF60Q9UHX1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PUF60Q9UHX1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PUF60Q9UHX1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PUF60Q9UHX1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PUF60Q9UHX1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PUF60Q9UHX1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PUF60Q9UHX1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PUF60Q9UHX1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PUF60Q9UHX1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PUF60Q9UHX1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PUF60Q9UHX1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PUF60Q9UHX1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PUF60Q9UHX1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PUF60Q9UHX1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PUF60Q9UHX1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PUF60Q9UHX1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PUF60Q9UHX1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PUF60Q9UHX1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PUF60Q9UHX1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PUF60Q9UHX1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PUF60Q9UHX1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PUF60Q9UHX1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PUF60Q9UHX1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PUF60Q9UHX1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PUF60Q9UHX1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PUF60Q9UHX1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PUF60Q9UHX1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PUF60Q9UHX1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PUF60Q9UHX1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PUF60Q9UHX1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PUF60Q9UHX1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PUF60Q9UHX1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PUF60Q9UHX1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PUF60Q9UHX1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PUF60Q9UHX1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PUF60Q9UHX1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PUF60Q9UHX1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PUF60Q9UHX1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PUF60Q9UHX1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PUF60Q9UHX1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PUF60Q9UHX1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PUF60Q9UHX1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms