Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPC4Q9UBN4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPC4Q9UBN4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPC4Q9UBN4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPC4Q9UBN4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPC4Q9UBN4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPC4Q9UBN4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRPC4Q9UBN4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRPC4Q9UBN4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRPC4Q9UBN4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRPC4Q9UBN4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRPC4Q9UBN4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRPC4Q9UBN4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRPC4Q9UBN4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRPC4Q9UBN4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRPC4Q9UBN4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRPC4Q9UBN4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRPC4Q9UBN4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRPC4Q9UBN4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRPC4Q9UBN4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRPC4Q9UBN4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRPC4Q9UBN4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRPC4Q9UBN4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRPC4Q9UBN4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPC4Q9UBN4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPC4Q9UBN4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPC4Q9UBN4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPC4Q9UBN4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPC4Q9UBN4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPC4Q9UBN4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRPC4Q9UBN4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRPC4Q9UBN4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC4Q9UBN4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC4Q9UBN4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC4Q9UBN4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC4Q9UBN4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC4Q9UBN4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPC4Q9UBN4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPC4Q9UBN4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPC4Q9UBN4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPC4Q9UBN4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPC4Q9UBN4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPC4Q9UBN4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPC4Q9UBN4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPC4Q9UBN4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPC4Q9UBN4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPC4Q9UBN4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPC4Q9UBN4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPC4Q9UBN4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPC4Q9UBN4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPC4Q9UBN4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPC4Q9UBN4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPC4Q9UBN4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPC4Q9UBN4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRPC4Q9UBN4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRPC4Q9UBN4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRPC4Q9UBN4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRPC4Q9UBN4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRPC4Q9UBN4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRPC4Q9UBN4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRPC4Q9UBN4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPC4Q9UBN4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPC4Q9UBN4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPC4Q9UBN4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPC4Q9UBN4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPC4Q9UBN4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPC4Q9UBN4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPC4Q9UBN4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPC4Q9UBN4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPC4Q9UBN4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPC4Q9UBN4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRPC4Q9UBN4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRPC4Q9UBN4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRPC4Q9UBN4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRPC4Q9UBN4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRPC4Q9UBN4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRPC4Q9UBN4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRPC4Q9UBN4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRPC4Q9UBN4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRPC4Q9UBN4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRPC4Q9UBN4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRPC4Q9UBN4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRPC4Q9UBN4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRPC4Q9UBN4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRPC4Q9UBN4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRPC4Q9UBN4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRPC4Q9UBN4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRPC4Q9UBN4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRPC4Q9UBN4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRPC4Q9UBN4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRPC4Q9UBN4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRPC4Q9UBN4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRPC4Q9UBN4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRPC4Q9UBN4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRPC4Q9UBN4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TRPC4Q9UBN4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRPC4Q9UBN4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRPC4Q9UBN4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRPC4Q9UBN4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRPC4Q9UBN4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms