Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTN3Q9P232 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTN3Q9P232 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTN3Q9P232 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTN3Q9P232 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNTN3Q9P232 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CNTN3Q9P232 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNTN3Q9P232 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNTN3Q9P232 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNTN3Q9P232 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNTN3Q9P232 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNTN3Q9P232 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNTN3Q9P232 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNTN3Q9P232 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CNTN3Q9P232 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CNTN3Q9P232 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNTN3Q9P232 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNTN3Q9P232 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNTN3Q9P232 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNTN3Q9P232 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNTN3Q9P232 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNTN3Q9P232 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNTN3Q9P232 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNTN3Q9P232 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNTN3Q9P232 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNTN3Q9P232 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNTN3Q9P232 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNTN3Q9P232 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNTN3Q9P232 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNTN3Q9P232 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNTN3Q9P232 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNTN3Q9P232 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNTN3Q9P232 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNTN3Q9P232 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNTN3Q9P232 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNTN3Q9P232 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNTN3Q9P232 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNTN3Q9P232 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CNTN3Q9P232 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNTN3Q9P232 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNTN3Q9P232 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNTN3Q9P232 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNTN3Q9P232 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNTN3Q9P232 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNTN3Q9P232 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNTN3Q9P232 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNTN3Q9P232 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNTN3Q9P232 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNTN3Q9P232 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNTN3Q9P232 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNTN3Q9P232 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNTN3Q9P232 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNTN3Q9P232 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNTN3Q9P232 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNTN3Q9P232 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNTN3Q9P232 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNTN3Q9P232 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNTN3Q9P232 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNTN3Q9P232 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNTN3Q9P232 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNTN3Q9P232 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNTN3Q9P232 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNTN3Q9P232 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNTN3Q9P232 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNTN3Q9P232 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNTN3Q9P232 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNTN3Q9P232 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNTN3Q9P232 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNTN3Q9P232 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNTN3Q9P232 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNTN3Q9P232 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNTN3Q9P232 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNTN3Q9P232 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CNTN3Q9P232 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNTN3Q9P232 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNTN3Q9P232 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNTN3Q9P232 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNTN3Q9P232 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNTN3Q9P232 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNTN3Q9P232 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNTN3Q9P232 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNTN3Q9P232 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNTN3Q9P232 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNTN3Q9P232 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNTN3Q9P232 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNTN3Q9P232 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNTN3Q9P232 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CNTN3Q9P232 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNTN3Q9P232 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNTN3Q9P232 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNTN3Q9P232 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNTN3Q9P232 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNTN3Q9P232 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNTN3Q9P232 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNTN3Q9P232 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNTN3Q9P232 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNTN3Q9P232 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNTN3Q9P232 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNTN3Q9P232 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNTN3Q9P232 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms