Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCMF1Q9P0J7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCMF1Q9P0J7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCMF1Q9P0J7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCMF1Q9P0J7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCMF1Q9P0J7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCMF1Q9P0J7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCMF1Q9P0J7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCMF1Q9P0J7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCMF1Q9P0J7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCMF1Q9P0J7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCMF1Q9P0J7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCMF1Q9P0J7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCMF1Q9P0J7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCMF1Q9P0J7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCMF1Q9P0J7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCMF1Q9P0J7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCMF1Q9P0J7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCMF1Q9P0J7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCMF1Q9P0J7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCMF1Q9P0J7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KCMF1Q9P0J7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCMF1Q9P0J7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCMF1Q9P0J7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCMF1Q9P0J7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCMF1Q9P0J7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCMF1Q9P0J7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCMF1Q9P0J7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCMF1Q9P0J7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCMF1Q9P0J7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCMF1Q9P0J7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCMF1Q9P0J7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCMF1Q9P0J7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCMF1Q9P0J7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCMF1Q9P0J7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCMF1Q9P0J7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCMF1Q9P0J7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCMF1Q9P0J7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCMF1Q9P0J7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCMF1Q9P0J7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCMF1Q9P0J7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCMF1Q9P0J7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCMF1Q9P0J7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCMF1Q9P0J7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCMF1Q9P0J7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCMF1Q9P0J7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KCMF1Q9P0J7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCMF1Q9P0J7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCMF1Q9P0J7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCMF1Q9P0J7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KCMF1Q9P0J7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCMF1Q9P0J7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KCMF1Q9P0J7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCMF1Q9P0J7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCMF1Q9P0J7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCMF1Q9P0J7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCMF1Q9P0J7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCMF1Q9P0J7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCMF1Q9P0J7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCMF1Q9P0J7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCMF1Q9P0J7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCMF1Q9P0J7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCMF1Q9P0J7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCMF1Q9P0J7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KCMF1Q9P0J7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KCMF1Q9P0J7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KCMF1Q9P0J7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCMF1Q9P0J7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KCMF1Q9P0J7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KCMF1Q9P0J7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCMF1Q9P0J7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KCMF1Q9P0J7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCMF1Q9P0J7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCMF1Q9P0J7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCMF1Q9P0J7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCMF1Q9P0J7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCMF1Q9P0J7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCMF1Q9P0J7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCMF1Q9P0J7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCMF1Q9P0J7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCMF1Q9P0J7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCMF1Q9P0J7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCMF1Q9P0J7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCMF1Q9P0J7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCMF1Q9P0J7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCMF1Q9P0J7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KCMF1Q9P0J7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCMF1Q9P0J7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCMF1Q9P0J7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCMF1Q9P0J7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCMF1Q9P0J7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCMF1Q9P0J7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCMF1Q9P0J7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCMF1Q9P0J7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KCMF1Q9P0J7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KCMF1Q9P0J7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCMF1Q9P0J7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCMF1Q9P0J7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCMF1Q9P0J7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCMF1Q9P0J7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms