Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HACD3Q9P035 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HACD3Q9P035 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HACD3Q9P035 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HACD3Q9P035 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HACD3Q9P035 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HACD3Q9P035 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HACD3Q9P035 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HACD3Q9P035 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HACD3Q9P035 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HACD3Q9P035 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HACD3Q9P035 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HACD3Q9P035 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HACD3Q9P035 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HACD3Q9P035 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HACD3Q9P035 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HACD3Q9P035 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HACD3Q9P035 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HACD3Q9P035 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HACD3Q9P035 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HACD3Q9P035 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HACD3Q9P035 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HACD3Q9P035 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HACD3Q9P035 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HACD3Q9P035 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HACD3Q9P035 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HACD3Q9P035 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HACD3Q9P035 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HACD3Q9P035 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HACD3Q9P035 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HACD3Q9P035 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HACD3Q9P035 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HACD3Q9P035 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HACD3Q9P035 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HACD3Q9P035 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HACD3Q9P035 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HACD3Q9P035 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HACD3Q9P035 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HACD3Q9P035 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HACD3Q9P035 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HACD3Q9P035 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HACD3Q9P035 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HACD3Q9P035 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HACD3Q9P035 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HACD3Q9P035 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HACD3Q9P035 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HACD3Q9P035 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HACD3Q9P035 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HACD3Q9P035 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HACD3Q9P035 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HACD3Q9P035 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HACD3Q9P035 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HACD3Q9P035 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HACD3Q9P035 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HACD3Q9P035 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HACD3Q9P035 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HACD3Q9P035 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HACD3Q9P035 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HACD3Q9P035 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HACD3Q9P035 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HACD3Q9P035 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HACD3Q9P035 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HACD3Q9P035 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HACD3Q9P035 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HACD3Q9P035 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HACD3Q9P035 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HACD3Q9P035 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HACD3Q9P035 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HACD3Q9P035 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HACD3Q9P035 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HACD3Q9P035 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HACD3Q9P035 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HACD3Q9P035 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HACD3Q9P035 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HACD3Q9P035 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HACD3Q9P035 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HACD3Q9P035 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HACD3Q9P035 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HACD3Q9P035 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HACD3Q9P035 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HACD3Q9P035 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HACD3Q9P035 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HACD3Q9P035 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HACD3Q9P035 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HACD3Q9P035 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HACD3Q9P035 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HACD3Q9P035 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HACD3Q9P035 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HACD3Q9P035 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HACD3Q9P035 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HACD3Q9P035 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HACD3Q9P035 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HACD3Q9P035 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HACD3Q9P035 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HACD3Q9P035 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HACD3Q9P035 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HACD3Q9P035 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HACD3Q9P035 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HACD3Q9P035 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HACD3Q9P035 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms