Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZS2

KLRF1, Killer cell lectin-like receptor subfamily F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRF1Q9NZS2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLRF1Q9NZS2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLRF1Q9NZS2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLRF1Q9NZS2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLRF1Q9NZS2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLRF1Q9NZS2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLRF1Q9NZS2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLRF1Q9NZS2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLRF1Q9NZS2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLRF1Q9NZS2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLRF1Q9NZS2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLRF1Q9NZS2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLRF1Q9NZS2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLRF1Q9NZS2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLRF1Q9NZS2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLRF1Q9NZS2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLRF1Q9NZS2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLRF1Q9NZS2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLRF1Q9NZS2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLRF1Q9NZS2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLRF1Q9NZS2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLRF1Q9NZS2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLRF1Q9NZS2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLRF1Q9NZS2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLRF1Q9NZS2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLRF1Q9NZS2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLRF1Q9NZS2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLRF1Q9NZS2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KLRF1Q9NZS2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLRF1Q9NZS2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KLRF1Q9NZS2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLRF1Q9NZS2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLRF1Q9NZS2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLRF1Q9NZS2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLRF1Q9NZS2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KLRF1Q9NZS2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KLRF1Q9NZS2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLRF1Q9NZS2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KLRF1Q9NZS2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLRF1Q9NZS2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLRF1Q9NZS2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLRF1Q9NZS2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLRF1Q9NZS2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLRF1Q9NZS2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLRF1Q9NZS2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLRF1Q9NZS2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLRF1Q9NZS2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLRF1Q9NZS2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLRF1Q9NZS2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLRF1Q9NZS2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLRF1Q9NZS2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLRF1Q9NZS2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLRF1Q9NZS2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLRF1Q9NZS2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLRF1Q9NZS2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLRF1Q9NZS2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLRF1Q9NZS2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLRF1Q9NZS2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLRF1Q9NZS2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLRF1Q9NZS2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLRF1Q9NZS2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLRF1Q9NZS2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLRF1Q9NZS2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLRF1Q9NZS2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLRF1Q9NZS2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLRF1Q9NZS2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KLRF1Q9NZS2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KLRF1Q9NZS2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
KLRF1Q9NZS2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLRF1Q9NZS2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLRF1Q9NZS2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KLRF1Q9NZS2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLRF1Q9NZS2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLRF1Q9NZS2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLRF1Q9NZS2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLRF1Q9NZS2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLRF1Q9NZS2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLRF1Q9NZS2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLRF1Q9NZS2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLRF1Q9NZS2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLRF1Q9NZS2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLRF1Q9NZS2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KLRF1Q9NZS2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLRF1Q9NZS2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLRF1Q9NZS2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLRF1Q9NZS2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLRF1Q9NZS2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLRF1Q9NZS2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLRF1Q9NZS2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLRF1Q9NZS2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLRF1Q9NZS2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLRF1Q9NZS2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLRF1Q9NZS2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLRF1Q9NZS2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLRF1Q9NZS2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KLRF1Q9NZS2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLRF1Q9NZS2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLRF1Q9NZS2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLRF1Q9NZS2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLRF1Q9NZS2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms