Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GDE1Q9NZC3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GDE1Q9NZC3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GDE1Q9NZC3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GDE1Q9NZC3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GDE1Q9NZC3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GDE1Q9NZC3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GDE1Q9NZC3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GDE1Q9NZC3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GDE1Q9NZC3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GDE1Q9NZC3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GDE1Q9NZC3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GDE1Q9NZC3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GDE1Q9NZC3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GDE1Q9NZC3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GDE1Q9NZC3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GDE1Q9NZC3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GDE1Q9NZC3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GDE1Q9NZC3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GDE1Q9NZC3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GDE1Q9NZC3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GDE1Q9NZC3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GDE1Q9NZC3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GDE1Q9NZC3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GDE1Q9NZC3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GDE1Q9NZC3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GDE1Q9NZC3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GDE1Q9NZC3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GDE1Q9NZC3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GDE1Q9NZC3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GDE1Q9NZC3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GDE1Q9NZC3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GDE1Q9NZC3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GDE1Q9NZC3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GDE1Q9NZC3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GDE1Q9NZC3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GDE1Q9NZC3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GDE1Q9NZC3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GDE1Q9NZC3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GDE1Q9NZC3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GDE1Q9NZC3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GDE1Q9NZC3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GDE1Q9NZC3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GDE1Q9NZC3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GDE1Q9NZC3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GDE1Q9NZC3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GDE1Q9NZC3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GDE1Q9NZC3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GDE1Q9NZC3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GDE1Q9NZC3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GDE1Q9NZC3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDE1Q9NZC3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDE1Q9NZC3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDE1Q9NZC3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GDE1Q9NZC3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GDE1Q9NZC3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GDE1Q9NZC3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GDE1Q9NZC3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDE1Q9NZC3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDE1Q9NZC3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDE1Q9NZC3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GDE1Q9NZC3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDE1Q9NZC3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDE1Q9NZC3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDE1Q9NZC3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDE1Q9NZC3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDE1Q9NZC3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDE1Q9NZC3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDE1Q9NZC3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDE1Q9NZC3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDE1Q9NZC3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GDE1Q9NZC3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDE1Q9NZC3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDE1Q9NZC3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDE1Q9NZC3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDE1Q9NZC3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GDE1Q9NZC3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GDE1Q9NZC3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GDE1Q9NZC3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GDE1Q9NZC3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GDE1Q9NZC3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GDE1Q9NZC3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GDE1Q9NZC3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GDE1Q9NZC3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDE1Q9NZC3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDE1Q9NZC3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDE1Q9NZC3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDE1Q9NZC3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDE1Q9NZC3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDE1Q9NZC3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDE1Q9NZC3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDE1Q9NZC3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDE1Q9NZC3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDE1Q9NZC3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDE1Q9NZC3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GDE1Q9NZC3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDE1Q9NZC3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDE1Q9NZC3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDE1Q9NZC3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GDE1Q9NZC3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
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