Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYK1

TLR7, Toll-like receptor 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,049 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR7Q9NYK1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TLR7Q9NYK1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TLR7Q9NYK1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TLR7Q9NYK1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TLR7Q9NYK1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
TLR7Q9NYK1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TLR7Q9NYK1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TLR7Q9NYK1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TLR7Q9NYK1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TLR7Q9NYK1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
TLR7Q9NYK1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TLR7Q9NYK1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TLR7Q9NYK1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
TLR7Q9NYK1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TLR7Q9NYK1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TLR7Q9NYK1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TLR7Q9NYK1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TLR7Q9NYK1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TLR7Q9NYK1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TLR7Q9NYK1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TLR7Q9NYK1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TLR7Q9NYK1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
TLR7Q9NYK1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TLR7Q9NYK1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TLR7Q9NYK1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
TLR7Q9NYK1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TLR7Q9NYK1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TLR7Q9NYK1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TLR7Q9NYK1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TLR7Q9NYK1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TLR7Q9NYK1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TLR7Q9NYK1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TLR7Q9NYK1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
TLR7Q9NYK1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TLR7Q9NYK1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TLR7Q9NYK1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TLR7Q9NYK1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TLR7Q9NYK1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TLR7Q9NYK1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TLR7Q9NYK1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TLR7Q9NYK1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TLR7Q9NYK1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TLR7Q9NYK1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TLR7Q9NYK1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TLR7Q9NYK1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TLR7Q9NYK1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TLR7Q9NYK1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TLR7Q9NYK1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TLR7Q9NYK1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TLR7Q9NYK1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TLR7Q9NYK1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TLR7Q9NYK1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TLR7Q9NYK1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TLR7Q9NYK1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TLR7Q9NYK1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TLR7Q9NYK1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TLR7Q9NYK1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TLR7Q9NYK1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TLR7Q9NYK1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TLR7Q9NYK1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TLR7Q9NYK1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TLR7Q9NYK1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TLR7Q9NYK1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TLR7Q9NYK1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TLR7Q9NYK1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TLR7Q9NYK1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TLR7Q9NYK1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TLR7Q9NYK1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TLR7Q9NYK1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TLR7Q9NYK1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TLR7Q9NYK1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
TLR7Q9NYK1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TLR7Q9NYK1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TLR7Q9NYK1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TLR7Q9NYK1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TLR7Q9NYK1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TLR7Q9NYK1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TLR7Q9NYK1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TLR7Q9NYK1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TLR7Q9NYK1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TLR7Q9NYK1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
TLR7Q9NYK1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TLR7Q9NYK1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TLR7Q9NYK1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TLR7Q9NYK1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TLR7Q9NYK1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TLR7Q9NYK1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TLR7Q9NYK1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TLR7Q9NYK1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TLR7Q9NYK1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
TLR7Q9NYK1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TLR7Q9NYK1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
TLR7Q9NYK1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
TLR7Q9NYK1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TLR7Q9NYK1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TLR7Q9NYK1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TLR7Q9NYK1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TLR7Q9NYK1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TLR7Q9NYK1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TLR7Q9NYK1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms