Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GIN1Q9NXP7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GIN1Q9NXP7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GIN1Q9NXP7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GIN1Q9NXP7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GIN1Q9NXP7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GIN1Q9NXP7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GIN1Q9NXP7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GIN1Q9NXP7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GIN1Q9NXP7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GIN1Q9NXP7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GIN1Q9NXP7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GIN1Q9NXP7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GIN1Q9NXP7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GIN1Q9NXP7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GIN1Q9NXP7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GIN1Q9NXP7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GIN1Q9NXP7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GIN1Q9NXP7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GIN1Q9NXP7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GIN1Q9NXP7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GIN1Q9NXP7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GIN1Q9NXP7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GIN1Q9NXP7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GIN1Q9NXP7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GIN1Q9NXP7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GIN1Q9NXP7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GIN1Q9NXP7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GIN1Q9NXP7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GIN1Q9NXP7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GIN1Q9NXP7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GIN1Q9NXP7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GIN1Q9NXP7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GIN1Q9NXP7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GIN1Q9NXP7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GIN1Q9NXP7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GIN1Q9NXP7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GIN1Q9NXP7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GIN1Q9NXP7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GIN1Q9NXP7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GIN1Q9NXP7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GIN1Q9NXP7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GIN1Q9NXP7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GIN1Q9NXP7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GIN1Q9NXP7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GIN1Q9NXP7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GIN1Q9NXP7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GIN1Q9NXP7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GIN1Q9NXP7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GIN1Q9NXP7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GIN1Q9NXP7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GIN1Q9NXP7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GIN1Q9NXP7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GIN1Q9NXP7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GIN1Q9NXP7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GIN1Q9NXP7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GIN1Q9NXP7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GIN1Q9NXP7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GIN1Q9NXP7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GIN1Q9NXP7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GIN1Q9NXP7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GIN1Q9NXP7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GIN1Q9NXP7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GIN1Q9NXP7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GIN1Q9NXP7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GIN1Q9NXP7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GIN1Q9NXP7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GIN1Q9NXP7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GIN1Q9NXP7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GIN1Q9NXP7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GIN1Q9NXP7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GIN1Q9NXP7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GIN1Q9NXP7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GIN1Q9NXP7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GIN1Q9NXP7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GIN1Q9NXP7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GIN1Q9NXP7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GIN1Q9NXP7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GIN1Q9NXP7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GIN1Q9NXP7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GIN1Q9NXP7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GIN1Q9NXP7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GIN1Q9NXP7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GIN1Q9NXP7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GIN1Q9NXP7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GIN1Q9NXP7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GIN1Q9NXP7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GIN1Q9NXP7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GIN1Q9NXP7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GIN1Q9NXP7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GIN1Q9NXP7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GIN1Q9NXP7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GIN1Q9NXP7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GIN1Q9NXP7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GIN1Q9NXP7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GIN1Q9NXP7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GIN1Q9NXP7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GIN1Q9NXP7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GIN1Q9NXP7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GIN1Q9NXP7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.2 ms