Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL9

MCM9, DNA helicase MCM9, humanhuman

Predictions only

Length 1,143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM9Q9NXL9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MCM9Q9NXL9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MCM9Q9NXL9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MCM9Q9NXL9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MCM9Q9NXL9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MCM9Q9NXL9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MCM9Q9NXL9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MCM9Q9NXL9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MCM9Q9NXL9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MCM9Q9NXL9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MCM9Q9NXL9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MCM9Q9NXL9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MCM9Q9NXL9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
MCM9Q9NXL9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MCM9Q9NXL9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MCM9Q9NXL9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MCM9Q9NXL9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MCM9Q9NXL9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MCM9Q9NXL9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MCM9Q9NXL9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
MCM9Q9NXL9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MCM9Q9NXL9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MCM9Q9NXL9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MCM9Q9NXL9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MCM9Q9NXL9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MCM9Q9NXL9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MCM9Q9NXL9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MCM9Q9NXL9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MCM9Q9NXL9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MCM9Q9NXL9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MCM9Q9NXL9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MCM9Q9NXL9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
MCM9Q9NXL9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
MCM9Q9NXL9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MCM9Q9NXL9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MCM9Q9NXL9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MCM9Q9NXL9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MCM9Q9NXL9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MCM9Q9NXL9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MCM9Q9NXL9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MCM9Q9NXL9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MCM9Q9NXL9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MCM9Q9NXL9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
MCM9Q9NXL9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
MCM9Q9NXL9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MCM9Q9NXL9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
MCM9Q9NXL9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MCM9Q9NXL9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MCM9Q9NXL9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MCM9Q9NXL9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MCM9Q9NXL9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MCM9Q9NXL9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MCM9Q9NXL9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MCM9Q9NXL9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MCM9Q9NXL9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MCM9Q9NXL9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MCM9Q9NXL9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MCM9Q9NXL9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MCM9Q9NXL9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MCM9Q9NXL9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
MCM9Q9NXL9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
MCM9Q9NXL9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
MCM9Q9NXL9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MCM9Q9NXL9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCM9Q9NXL9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCM9Q9NXL9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCM9Q9NXL9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCM9Q9NXL9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MCM9Q9NXL9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MCM9Q9NXL9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MCM9Q9NXL9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MCM9Q9NXL9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MCM9Q9NXL9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MCM9Q9NXL9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MCM9Q9NXL9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MCM9Q9NXL9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MCM9Q9NXL9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MCM9Q9NXL9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MCM9Q9NXL9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MCM9Q9NXL9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MCM9Q9NXL9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MCM9Q9NXL9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MCM9Q9NXL9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MCM9Q9NXL9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MCM9Q9NXL9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MCM9Q9NXL9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MCM9Q9NXL9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MCM9Q9NXL9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MCM9Q9NXL9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
MCM9Q9NXL9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
MCM9Q9NXL9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MCM9Q9NXL9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
MCM9Q9NXL9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MCM9Q9NXL9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MCM9Q9NXL9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MCM9Q9NXL9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MCM9Q9NXL9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MCM9Q9NXL9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MCM9Q9NXL9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MCM9Q9NXL9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms