Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASF1BQ9NVP2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASF1BQ9NVP2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASF1BQ9NVP2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASF1BQ9NVP2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASF1BQ9NVP2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASF1BQ9NVP2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASF1BQ9NVP2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASF1BQ9NVP2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASF1BQ9NVP2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASF1BQ9NVP2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASF1BQ9NVP2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ASF1BQ9NVP2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ASF1BQ9NVP2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASF1BQ9NVP2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASF1BQ9NVP2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASF1BQ9NVP2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASF1BQ9NVP2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASF1BQ9NVP2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ASF1BQ9NVP2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASF1BQ9NVP2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASF1BQ9NVP2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASF1BQ9NVP2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ASF1BQ9NVP2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASF1BQ9NVP2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ASF1BQ9NVP2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASF1BQ9NVP2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASF1BQ9NVP2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASF1BQ9NVP2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASF1BQ9NVP2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASF1BQ9NVP2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ASF1BQ9NVP2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASF1BQ9NVP2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASF1BQ9NVP2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ASF1BQ9NVP2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASF1BQ9NVP2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASF1BQ9NVP2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASF1BQ9NVP2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASF1BQ9NVP2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASF1BQ9NVP2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASF1BQ9NVP2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASF1BQ9NVP2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASF1BQ9NVP2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASF1BQ9NVP2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASF1BQ9NVP2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASF1BQ9NVP2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASF1BQ9NVP2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASF1BQ9NVP2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASF1BQ9NVP2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASF1BQ9NVP2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASF1BQ9NVP2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASF1BQ9NVP2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASF1BQ9NVP2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASF1BQ9NVP2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASF1BQ9NVP2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASF1BQ9NVP2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ASF1BQ9NVP2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASF1BQ9NVP2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASF1BQ9NVP2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASF1BQ9NVP2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASF1BQ9NVP2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASF1BQ9NVP2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ASF1BQ9NVP2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASF1BQ9NVP2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASF1BQ9NVP2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASF1BQ9NVP2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASF1BQ9NVP2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASF1BQ9NVP2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASF1BQ9NVP2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASF1BQ9NVP2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASF1BQ9NVP2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASF1BQ9NVP2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASF1BQ9NVP2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASF1BQ9NVP2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASF1BQ9NVP2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASF1BQ9NVP2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASF1BQ9NVP2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASF1BQ9NVP2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASF1BQ9NVP2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASF1BQ9NVP2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASF1BQ9NVP2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASF1BQ9NVP2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASF1BQ9NVP2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASF1BQ9NVP2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASF1BQ9NVP2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASF1BQ9NVP2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASF1BQ9NVP2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASF1BQ9NVP2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASF1BQ9NVP2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASF1BQ9NVP2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASF1BQ9NVP2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASF1BQ9NVP2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASF1BQ9NVP2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASF1BQ9NVP2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASF1BQ9NVP2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ASF1BQ9NVP2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASF1BQ9NVP2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASF1BQ9NVP2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASF1BQ9NVP2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASF1BQ9NVP2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms