Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV64

TMEM39A, Transmembrane protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39AQ9NV64 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM39AQ9NV64 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM39AQ9NV64 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM39AQ9NV64 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM39AQ9NV64 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM39AQ9NV64 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM39AQ9NV64 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM39AQ9NV64 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM39AQ9NV64 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM39AQ9NV64 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM39AQ9NV64 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM39AQ9NV64 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM39AQ9NV64 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM39AQ9NV64 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM39AQ9NV64 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM39AQ9NV64 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM39AQ9NV64 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM39AQ9NV64 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM39AQ9NV64 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM39AQ9NV64 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM39AQ9NV64 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM39AQ9NV64 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM39AQ9NV64 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM39AQ9NV64 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM39AQ9NV64 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM39AQ9NV64 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM39AQ9NV64 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM39AQ9NV64 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM39AQ9NV64 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM39AQ9NV64 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM39AQ9NV64 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM39AQ9NV64 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM39AQ9NV64 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM39AQ9NV64 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM39AQ9NV64 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM39AQ9NV64 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TMEM39AQ9NV64 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM39AQ9NV64 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM39AQ9NV64 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM39AQ9NV64 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM39AQ9NV64 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM39AQ9NV64 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM39AQ9NV64 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM39AQ9NV64 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM39AQ9NV64 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM39AQ9NV64 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM39AQ9NV64 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM39AQ9NV64 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM39AQ9NV64 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM39AQ9NV64 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM39AQ9NV64 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM39AQ9NV64 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM39AQ9NV64 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM39AQ9NV64 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM39AQ9NV64 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM39AQ9NV64 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM39AQ9NV64 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM39AQ9NV64 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM39AQ9NV64 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM39AQ9NV64 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM39AQ9NV64 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM39AQ9NV64 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM39AQ9NV64 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMEM39AQ9NV64 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMEM39AQ9NV64 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMEM39AQ9NV64 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMEM39AQ9NV64 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMEM39AQ9NV64 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMEM39AQ9NV64 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMEM39AQ9NV64 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM39AQ9NV64 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM39AQ9NV64 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM39AQ9NV64 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM39AQ9NV64 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM39AQ9NV64 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM39AQ9NV64 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM39AQ9NV64 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM39AQ9NV64 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM39AQ9NV64 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM39AQ9NV64 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM39AQ9NV64 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM39AQ9NV64 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM39AQ9NV64 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM39AQ9NV64 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM39AQ9NV64 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM39AQ9NV64 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM39AQ9NV64 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM39AQ9NV64 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM39AQ9NV64 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM39AQ9NV64 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM39AQ9NV64 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM39AQ9NV64 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM39AQ9NV64 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM39AQ9NV64 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM39AQ9NV64 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM39AQ9NV64 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM39AQ9NV64 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM39AQ9NV64 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM39AQ9NV64 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM39AQ9NV64 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms