Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GINM1Q9NU53 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GINM1Q9NU53 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GINM1Q9NU53 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
GINM1Q9NU53 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GINM1Q9NU53 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GINM1Q9NU53 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GINM1Q9NU53 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GINM1Q9NU53 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
GINM1Q9NU53 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GINM1Q9NU53 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GINM1Q9NU53 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GINM1Q9NU53 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
GINM1Q9NU53 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GINM1Q9NU53 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GINM1Q9NU53 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GINM1Q9NU53 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GINM1Q9NU53 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GINM1Q9NU53 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GINM1Q9NU53 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GINM1Q9NU53 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GINM1Q9NU53 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GINM1Q9NU53 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
GINM1Q9NU53 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GINM1Q9NU53 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
GINM1Q9NU53 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
GINM1Q9NU53 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GINM1Q9NU53 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GINM1Q9NU53 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GINM1Q9NU53 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GINM1Q9NU53 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GINM1Q9NU53 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GINM1Q9NU53 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GINM1Q9NU53 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GINM1Q9NU53 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GINM1Q9NU53 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GINM1Q9NU53 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GINM1Q9NU53 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GINM1Q9NU53 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GINM1Q9NU53 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
GINM1Q9NU53 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
GINM1Q9NU53 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GINM1Q9NU53 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GINM1Q9NU53 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GINM1Q9NU53 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GINM1Q9NU53 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GINM1Q9NU53 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GINM1Q9NU53 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GINM1Q9NU53 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GINM1Q9NU53 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GINM1Q9NU53 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GINM1Q9NU53 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GINM1Q9NU53 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GINM1Q9NU53 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GINM1Q9NU53 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GINM1Q9NU53 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GINM1Q9NU53 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GINM1Q9NU53 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GINM1Q9NU53 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GINM1Q9NU53 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
GINM1Q9NU53 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GINM1Q9NU53 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GINM1Q9NU53 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GINM1Q9NU53 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GINM1Q9NU53 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GINM1Q9NU53 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GINM1Q9NU53 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GINM1Q9NU53 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GINM1Q9NU53 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GINM1Q9NU53 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GINM1Q9NU53 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GINM1Q9NU53 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GINM1Q9NU53 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GINM1Q9NU53 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GINM1Q9NU53 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GINM1Q9NU53 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GINM1Q9NU53 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GINM1Q9NU53 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GINM1Q9NU53 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GINM1Q9NU53 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GINM1Q9NU53 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GINM1Q9NU53 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GINM1Q9NU53 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GINM1Q9NU53 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GINM1Q9NU53 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GINM1Q9NU53 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GINM1Q9NU53 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GINM1Q9NU53 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GINM1Q9NU53 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GINM1Q9NU53 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GINM1Q9NU53 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GINM1Q9NU53 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GINM1Q9NU53 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GINM1Q9NU53 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GINM1Q9NU53 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GINM1Q9NU53 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GINM1Q9NU53 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GINM1Q9NU53 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GINM1Q9NU53 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GINM1Q9NU53 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms