Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTK1

DEPP, Protein DEPP, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPPQ9NTK1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DEPPQ9NTK1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DEPPQ9NTK1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DEPPQ9NTK1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DEPPQ9NTK1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DEPPQ9NTK1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DEPPQ9NTK1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DEPPQ9NTK1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DEPPQ9NTK1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DEPPQ9NTK1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DEPPQ9NTK1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEPPQ9NTK1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEPPQ9NTK1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEPPQ9NTK1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEPPQ9NTK1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEPPQ9NTK1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEPPQ9NTK1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEPPQ9NTK1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DEPPQ9NTK1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DEPPQ9NTK1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DEPPQ9NTK1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DEPPQ9NTK1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DEPPQ9NTK1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DEPPQ9NTK1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DEPPQ9NTK1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DEPPQ9NTK1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DEPPQ9NTK1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DEPPQ9NTK1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DEPPQ9NTK1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEPPQ9NTK1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEPPQ9NTK1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEPPQ9NTK1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEPPQ9NTK1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEPPQ9NTK1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEPPQ9NTK1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEPPQ9NTK1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DEPPQ9NTK1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DEPPQ9NTK1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DEPPQ9NTK1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DEPPQ9NTK1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DEPPQ9NTK1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DEPPQ9NTK1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DEPPQ9NTK1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DEPPQ9NTK1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DEPPQ9NTK1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DEPPQ9NTK1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DEPPQ9NTK1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DEPPQ9NTK1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DEPPQ9NTK1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DEPPQ9NTK1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DEPPQ9NTK1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DEPPQ9NTK1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DEPPQ9NTK1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DEPPQ9NTK1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DEPPQ9NTK1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DEPPQ9NTK1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DEPPQ9NTK1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DEPPQ9NTK1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DEPPQ9NTK1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DEPPQ9NTK1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DEPPQ9NTK1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DEPPQ9NTK1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DEPPQ9NTK1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DEPPQ9NTK1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DEPPQ9NTK1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DEPPQ9NTK1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DEPPQ9NTK1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DEPPQ9NTK1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DEPPQ9NTK1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DEPPQ9NTK1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DEPPQ9NTK1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DEPPQ9NTK1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DEPPQ9NTK1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DEPPQ9NTK1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DEPPQ9NTK1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DEPPQ9NTK1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DEPPQ9NTK1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DEPPQ9NTK1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DEPPQ9NTK1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DEPPQ9NTK1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DEPPQ9NTK1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DEPPQ9NTK1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DEPPQ9NTK1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DEPPQ9NTK1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DEPPQ9NTK1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DEPPQ9NTK1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DEPPQ9NTK1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DEPPQ9NTK1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DEPPQ9NTK1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DEPPQ9NTK1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DEPPQ9NTK1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DEPPQ9NTK1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DEPPQ9NTK1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DEPPQ9NTK1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DEPPQ9NTK1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEPPQ9NTK1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEPPQ9NTK1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEPPQ9NTK1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEPPQ9NTK1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEPPQ9NTK1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms