Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF275Q9NSD4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF275Q9NSD4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF275Q9NSD4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF275Q9NSD4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF275Q9NSD4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF275Q9NSD4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF275Q9NSD4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF275Q9NSD4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF275Q9NSD4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF275Q9NSD4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF275Q9NSD4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF275Q9NSD4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF275Q9NSD4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF275Q9NSD4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF275Q9NSD4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF275Q9NSD4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF275Q9NSD4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF275Q9NSD4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF275Q9NSD4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF275Q9NSD4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF275Q9NSD4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF275Q9NSD4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF275Q9NSD4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF275Q9NSD4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF275Q9NSD4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF275Q9NSD4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF275Q9NSD4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF275Q9NSD4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF275Q9NSD4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF275Q9NSD4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF275Q9NSD4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF275Q9NSD4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF275Q9NSD4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF275Q9NSD4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF275Q9NSD4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF275Q9NSD4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF275Q9NSD4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF275Q9NSD4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF275Q9NSD4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF275Q9NSD4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF275Q9NSD4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF275Q9NSD4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF275Q9NSD4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF275Q9NSD4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF275Q9NSD4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF275Q9NSD4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF275Q9NSD4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF275Q9NSD4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF275Q9NSD4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF275Q9NSD4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF275Q9NSD4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF275Q9NSD4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF275Q9NSD4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF275Q9NSD4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF275Q9NSD4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF275Q9NSD4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF275Q9NSD4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF275Q9NSD4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF275Q9NSD4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF275Q9NSD4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF275Q9NSD4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF275Q9NSD4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF275Q9NSD4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF275Q9NSD4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF275Q9NSD4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF275Q9NSD4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF275Q9NSD4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF275Q9NSD4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF275Q9NSD4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF275Q9NSD4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF275Q9NSD4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF275Q9NSD4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF275Q9NSD4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF275Q9NSD4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF275Q9NSD4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF275Q9NSD4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF275Q9NSD4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF275Q9NSD4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF275Q9NSD4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF275Q9NSD4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF275Q9NSD4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF275Q9NSD4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF275Q9NSD4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF275Q9NSD4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF275Q9NSD4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF275Q9NSD4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF275Q9NSD4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF275Q9NSD4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF275Q9NSD4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF275Q9NSD4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF275Q9NSD4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF275Q9NSD4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF275Q9NSD4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF275Q9NSD4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF275Q9NSD4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF275Q9NSD4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF275Q9NSD4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF275Q9NSD4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF275Q9NSD4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms