Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW3

APOBEC3C, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3C, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3CQ9NRW3 MYL6-208ENST00000547703 675 ntTSL 513.49□□□□□ -0.252e-12■■■□□ 15
APOBEC3CQ9NRW3 MYL6-214ENST00000549392 411 ntTSL 59.95□□□□□ -0.822e-12■■■□□ 15
APOBEC3CQ9NRW3 MYL6-221ENST00000552297 454 ntTSL 37.23□□□□□ -1.252e-12■■■□□ 15
APOBEC3CQ9NRW3 TRMT112-204ENST00000537918 559 ntTSL 1 (best)20.59■□□□□ 0.892e-7■■■□□ 15
APOBEC3CQ9NRW3 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.712e-7■■■□□ 15
APOBEC3CQ9NRW3 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.572e-7■■■□□ 15
APOBEC3CQ9NRW3 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.392e-7■■■□□ 15
APOBEC3CQ9NRW3 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.252e-7■■■□□ 15
APOBEC3CQ9NRW3 TRMT112-205ENST00000539854 659 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.772e-7■■■□□ 15
APOBEC3CQ9NRW3 APOE-205ENST00000485628 771 ntTSL 1 (best)16.85■□□□□ 0.291e-7■■■□□ 14.9
APOBEC3CQ9NRW3 PRDX2-205ENST00000478908 413 ntTSL 211.85□□□□□ -0.515e-7■■■□□ 14.9
APOBEC3CQ9NRW3 PRDX2-204ENST00000477555 699 ntTSL 211.8□□□□□ -0.525e-7■■■□□ 14.9
APOBEC3CQ9NRW3 PRDX2-206ENST00000498785 505 ntTSL 211.06□□□□□ -0.645e-7■■■□□ 14.9
APOBEC3CQ9NRW3 CKS2-201ENST00000314355 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.172e-6■■■□□ 14.9
APOBEC3CQ9NRW3 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.491e-10■■■□□ 14.9
APOBEC3CQ9NRW3 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.091e-10■■■□□ 14.9
APOBEC3CQ9NRW3 DAD1-204ENST00000538631 441 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.681e-10■■■□□ 14.9
APOBEC3CQ9NRW3 DAD1-203ENST00000535847 591 ntTSL 29.93□□□□□ -0.821e-10■■■□□ 14.9
APOBEC3CQ9NRW3 DAD1-202ENST00000489532 339 ntTSL 33.04□□□□□ -1.921e-10■■■□□ 14.9
APOBEC3CQ9NRW3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.563e-6■■■□□ 14.9
APOBEC3CQ9NRW3 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.313e-6■■■□□ 14.9
APOBEC3CQ9NRW3 COPS6-204ENST00000426712 716 ntTSL 39.85□□□□□ -0.833e-6■■■□□ 14.9
APOBEC3CQ9NRW3 PSMB3-209ENST00000614132 426 ntTSL 25.35□□□□□ -1.554e-7■■■□□ 14.8
APOBEC3CQ9NRW3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.92e-6■■■□□ 14.8
APOBEC3CQ9NRW3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.772e-6■■■□□ 14.8
APOBEC3CQ9NRW3 CALM2-203ENST00000432899 1004 ntTSL 514.96□□□□□ -0.012e-6■■■□□ 14.8
APOBEC3CQ9NRW3 CALM2-206ENST00000482532 1891 ntTSL 211.65□□□□□ -0.542e-6■■■□□ 14.8
APOBEC3CQ9NRW3 STPG4-206ENST00000422269 983 ntTSL 211.52□□□□□ -0.572e-6■■■□□ 14.8
APOBEC3CQ9NRW3 CALM2-202ENST00000409563 770 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.662e-6■■■□□ 14.8
APOBEC3CQ9NRW3 CALM2-204ENST00000456319 703 ntTSL 23.22□□□□□ -1.892e-6■■■□□ 14.8
APOBEC3CQ9NRW3 CALM2-205ENST00000460218 4502 ntTSL 1 (best)1.71□□□□□ -2.142e-6■■■□□ 14.8
APOBEC3CQ9NRW3 RNA5SP149-201ENST00000364952 92 ntBASIC8.69□□□□□ -1.021e-323■■■□□ 14.8
APOBEC3CQ9NRW3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.16e-13■■■□□ 14.8
APOBEC3CQ9NRW3 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.036e-13■■■□□ 14.8
APOBEC3CQ9NRW3 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.216e-13■■■□□ 14.8
APOBEC3CQ9NRW3 RPS23-205ENST00000510019 1019 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.236e-13■■■□□ 14.8
APOBEC3CQ9NRW3 RPS23-203ENST00000504293 576 ntTSL 1 (best)9.16□□□□□ -0.946e-13■■■□□ 14.8
APOBEC3CQ9NRW3 RPS23-208ENST00000512493 443 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.136e-13■■■□□ 14.8
APOBEC3CQ9NRW3 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.141e-7■■■□□ 14.8
APOBEC3CQ9NRW3 MYL4-208ENST00000572316 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.291e-7■■■□□ 14.8
APOBEC3CQ9NRW3 MYL4-206ENST00000571981 920 ntTSL 311.37□□□□□ -0.591e-7■■■□□ 14.8
APOBEC3CQ9NRW3 MYL4-201ENST00000354968 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.591e-7■■■□□ 14.8
APOBEC3CQ9NRW3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.141e-7■■■□□ 14.7
APOBEC3CQ9NRW3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.691e-7■■■□□ 14.7
APOBEC3CQ9NRW3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.541e-7■■■□□ 14.7
APOBEC3CQ9NRW3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.451e-7■■■□□ 14.7
APOBEC3CQ9NRW3 RRP1-202ENST00000471909 2544 ntTSL 1 (best)17.27■□□□□ 0.361e-7■■■□□ 14.7
APOBEC3CQ9NRW3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.171e-7■■■□□ 14.7
APOBEC3CQ9NRW3 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.111e-7■■■□□ 14.7
APOBEC3CQ9NRW3 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.081e-7■■■□□ 14.7
APOBEC3CQ9NRW3 RNPS1-206ENST00000562205 2223 ntTSL 215.35■□□□□ 0.051e-7■■■□□ 14.7
APOBEC3CQ9NRW3 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.081e-7■■■□□ 14.7
APOBEC3CQ9NRW3 RRP1-201ENST00000467112 3019 ntTSL 1 (best)14□□□□□ -0.171e-7■■■□□ 14.7
APOBEC3CQ9NRW3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.642e-9■■■□□ 14.6
APOBEC3CQ9NRW3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.62e-9■■■□□ 14.6
APOBEC3CQ9NRW3 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.112e-9■■■□□ 14.6
APOBEC3CQ9NRW3 UROD-210ENST00000466193 524 ntTSL 219.99■□□□□ 0.794e-7■■■□□ 14.6
APOBEC3CQ9NRW3 UROD-209ENST00000465678 756 ntTSL 213.57□□□□□ -0.244e-7■■■□□ 14.6
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFS7-220ENST00000622587 802 ntTSL 520.07■□□□□ 0.82e-6■■■□□ 14.6
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.752e-6■■■□□ 14.6
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFS7-215ENST00000546172 869 ntTSL 519.58■□□□□ 0.722e-6■■■□□ 14.6
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.572e-6■■■□□ 14.6
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFS7-212ENST00000540530 1707 ntTSL 218.64■□□□□ 0.572e-6■■■□□ 14.6
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFS7-213ENST00000543289 3356 ntTSL 217.62■□□□□ 0.412e-6■■■□□ 14.6
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.292e-6■■■□□ 14.6
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFS7-205ENST00000534853 745 ntTSL 516.8■□□□□ 0.282e-6■■■□□ 14.6
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFS7-206ENST00000535382 3050 ntTSL 213.79□□□□□ -0.22e-6■■■□□ 14.6
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.262e-6■■■□□ 14.6
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFS7-214ENST00000545446 3089 ntTSL 212.24□□□□□ -0.452e-6■■■□□ 14.6
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFA13-206ENST00000511584 640 ntTSL 216.03■□□□□ 0.161e-14■■■□□ 14.6
APOBEC3CQ9NRW3 RPS9-210ENST00000460761 644 ntTSL 215.81■□□□□ 0.124e-25■■■□□ 14.6
APOBEC3CQ9NRW3 UROD-214ENST00000478467 857 ntTSL 314.28□□□□□ -0.123e-7■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 UROD-215ENST00000486699 968 ntTSL 312.76□□□□□ -0.373e-7■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 UROD-211ENST00000469548 1044 ntTSL 212.62□□□□□ -0.393e-7■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 UROD-202ENST00000428106 682 ntTSL 310.49□□□□□ -0.733e-7■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.742e-6■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.712e-6■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.152e-6■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.761e-11■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.692e-6■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.682e-6■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.642e-6■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.592e-6■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 CCS-205ENST00000530384 1196 ntTSL 518.62■□□□□ 0.572e-6■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 CCS-206ENST00000530961 1214 ntTSL 516.49■□□□□ 0.232e-6■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 DSTN-202ENST00000449141 795 ntTSL 316.26■□□□□ 0.192e-6■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.132e-6■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 PSMD11-203ENST00000469475 473 ntTSL 215.68■□□□□ 0.12e-6■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.011e-11■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.052e-6■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.11e-11■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.132e-6■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 CCS-209ENST00000534763 777 ntTSL 214.07□□□□□ -0.162e-6■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 SLC50A1-214ENST00000622581 1245 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.231e-11■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 MYADM-204ENST00000391770 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.242e-6■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.272e-6■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 CCS-202ENST00000525435 798 ntTSL 213.37□□□□□ -0.272e-6■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 SLC50A1-208ENST00000484027 596 ntTSL 312.87□□□□□ -0.351e-11■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 SLC50A1-204ENST00000368405 1003 ntTSL 212.87□□□□□ -0.351e-11■■□□□ 14.5
APOBEC3CQ9NRW3 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.382e-6■■□□□ 14.5
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