Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDHAF3Q9NRP4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDHAF3Q9NRP4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDHAF3Q9NRP4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDHAF3Q9NRP4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDHAF3Q9NRP4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDHAF3Q9NRP4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDHAF3Q9NRP4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDHAF3Q9NRP4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDHAF3Q9NRP4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDHAF3Q9NRP4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDHAF3Q9NRP4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDHAF3Q9NRP4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDHAF3Q9NRP4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDHAF3Q9NRP4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDHAF3Q9NRP4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SDHAF3Q9NRP4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SDHAF3Q9NRP4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDHAF3Q9NRP4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDHAF3Q9NRP4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDHAF3Q9NRP4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDHAF3Q9NRP4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDHAF3Q9NRP4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDHAF3Q9NRP4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDHAF3Q9NRP4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDHAF3Q9NRP4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDHAF3Q9NRP4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDHAF3Q9NRP4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDHAF3Q9NRP4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDHAF3Q9NRP4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDHAF3Q9NRP4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDHAF3Q9NRP4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDHAF3Q9NRP4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDHAF3Q9NRP4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDHAF3Q9NRP4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDHAF3Q9NRP4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDHAF3Q9NRP4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDHAF3Q9NRP4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDHAF3Q9NRP4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDHAF3Q9NRP4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDHAF3Q9NRP4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDHAF3Q9NRP4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDHAF3Q9NRP4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDHAF3Q9NRP4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDHAF3Q9NRP4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDHAF3Q9NRP4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDHAF3Q9NRP4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDHAF3Q9NRP4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDHAF3Q9NRP4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDHAF3Q9NRP4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDHAF3Q9NRP4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDHAF3Q9NRP4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDHAF3Q9NRP4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDHAF3Q9NRP4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDHAF3Q9NRP4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDHAF3Q9NRP4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDHAF3Q9NRP4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SDHAF3Q9NRP4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SDHAF3Q9NRP4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDHAF3Q9NRP4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDHAF3Q9NRP4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDHAF3Q9NRP4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDHAF3Q9NRP4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDHAF3Q9NRP4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDHAF3Q9NRP4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDHAF3Q9NRP4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDHAF3Q9NRP4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDHAF3Q9NRP4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDHAF3Q9NRP4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDHAF3Q9NRP4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDHAF3Q9NRP4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDHAF3Q9NRP4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDHAF3Q9NRP4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDHAF3Q9NRP4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDHAF3Q9NRP4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDHAF3Q9NRP4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDHAF3Q9NRP4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDHAF3Q9NRP4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDHAF3Q9NRP4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDHAF3Q9NRP4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDHAF3Q9NRP4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDHAF3Q9NRP4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SDHAF3Q9NRP4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDHAF3Q9NRP4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDHAF3Q9NRP4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDHAF3Q9NRP4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SDHAF3Q9NRP4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDHAF3Q9NRP4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDHAF3Q9NRP4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDHAF3Q9NRP4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDHAF3Q9NRP4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SDHAF3Q9NRP4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SDHAF3Q9NRP4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDHAF3Q9NRP4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDHAF3Q9NRP4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDHAF3Q9NRP4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDHAF3Q9NRP4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDHAF3Q9NRP4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SDHAF3Q9NRP4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDHAF3Q9NRP4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms