Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR96

TLR9, Toll-like receptor 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR9Q9NR96 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TLR9Q9NR96 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TLR9Q9NR96 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TLR9Q9NR96 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TLR9Q9NR96 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TLR9Q9NR96 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TLR9Q9NR96 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TLR9Q9NR96 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TLR9Q9NR96 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TLR9Q9NR96 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TLR9Q9NR96 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TLR9Q9NR96 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TLR9Q9NR96 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TLR9Q9NR96 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TLR9Q9NR96 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TLR9Q9NR96 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TLR9Q9NR96 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TLR9Q9NR96 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TLR9Q9NR96 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TLR9Q9NR96 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TLR9Q9NR96 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TLR9Q9NR96 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TLR9Q9NR96 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TLR9Q9NR96 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TLR9Q9NR96 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TLR9Q9NR96 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TLR9Q9NR96 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TLR9Q9NR96 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TLR9Q9NR96 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TLR9Q9NR96 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TLR9Q9NR96 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TLR9Q9NR96 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TLR9Q9NR96 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TLR9Q9NR96 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TLR9Q9NR96 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TLR9Q9NR96 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TLR9Q9NR96 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TLR9Q9NR96 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TLR9Q9NR96 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TLR9Q9NR96 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TLR9Q9NR96 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TLR9Q9NR96 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TLR9Q9NR96 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TLR9Q9NR96 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TLR9Q9NR96 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TLR9Q9NR96 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TLR9Q9NR96 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TLR9Q9NR96 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TLR9Q9NR96 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TLR9Q9NR96 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TLR9Q9NR96 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TLR9Q9NR96 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TLR9Q9NR96 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TLR9Q9NR96 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TLR9Q9NR96 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TLR9Q9NR96 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TLR9Q9NR96 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TLR9Q9NR96 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TLR9Q9NR96 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TLR9Q9NR96 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TLR9Q9NR96 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TLR9Q9NR96 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TLR9Q9NR96 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TLR9Q9NR96 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TLR9Q9NR96 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TLR9Q9NR96 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TLR9Q9NR96 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TLR9Q9NR96 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TLR9Q9NR96 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TLR9Q9NR96 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TLR9Q9NR96 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TLR9Q9NR96 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TLR9Q9NR96 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TLR9Q9NR96 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TLR9Q9NR96 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TLR9Q9NR96 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TLR9Q9NR96 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TLR9Q9NR96 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TLR9Q9NR96 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TLR9Q9NR96 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TLR9Q9NR96 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TLR9Q9NR96 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TLR9Q9NR96 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TLR9Q9NR96 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TLR9Q9NR96 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TLR9Q9NR96 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
TLR9Q9NR96 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TLR9Q9NR96 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TLR9Q9NR96 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TLR9Q9NR96 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TLR9Q9NR96 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TLR9Q9NR96 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TLR9Q9NR96 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TLR9Q9NR96 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TLR9Q9NR96 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TLR9Q9NR96 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TLR9Q9NR96 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TLR9Q9NR96 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TLR9Q9NR96 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TLR9Q9NR96 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms