Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARHGEF4Q9NR80 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ARHGEF4Q9NR80 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ARHGEF4Q9NR80 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARHGEF4Q9NR80 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGEF4Q9NR80 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGEF4Q9NR80 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGEF4Q9NR80 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGEF4Q9NR80 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGEF4Q9NR80 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGEF4Q9NR80 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGEF4Q9NR80 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGEF4Q9NR80 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGEF4Q9NR80 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGEF4Q9NR80 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGEF4Q9NR80 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGEF4Q9NR80 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGEF4Q9NR80 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGEF4Q9NR80 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGEF4Q9NR80 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGEF4Q9NR80 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGEF4Q9NR80 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGEF4Q9NR80 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGEF4Q9NR80 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGEF4Q9NR80 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGEF4Q9NR80 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGEF4Q9NR80 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGEF4Q9NR80 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGEF4Q9NR80 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGEF4Q9NR80 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARHGEF4Q9NR80 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARHGEF4Q9NR80 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARHGEF4Q9NR80 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARHGEF4Q9NR80 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARHGEF4Q9NR80 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARHGEF4Q9NR80 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ARHGEF4Q9NR80 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARHGEF4Q9NR80 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARHGEF4Q9NR80 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARHGEF4Q9NR80 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGEF4Q9NR80 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGEF4Q9NR80 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGEF4Q9NR80 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGEF4Q9NR80 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGEF4Q9NR80 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGEF4Q9NR80 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGEF4Q9NR80 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGEF4Q9NR80 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGEF4Q9NR80 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGEF4Q9NR80 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGEF4Q9NR80 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGEF4Q9NR80 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGEF4Q9NR80 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGEF4Q9NR80 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGEF4Q9NR80 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGEF4Q9NR80 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGEF4Q9NR80 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGEF4Q9NR80 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGEF4Q9NR80 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGEF4Q9NR80 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGEF4Q9NR80 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGEF4Q9NR80 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGEF4Q9NR80 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGEF4Q9NR80 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGEF4Q9NR80 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGEF4Q9NR80 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGEF4Q9NR80 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGEF4Q9NR80 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGEF4Q9NR80 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGEF4Q9NR80 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARHGEF4Q9NR80 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARHGEF4Q9NR80 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARHGEF4Q9NR80 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
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