Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR12

PDLIM7, PDZ and LIM domain protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM7Q9NR12 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDLIM7Q9NR12 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDLIM7Q9NR12 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PDLIM7Q9NR12 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDLIM7Q9NR12 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PDLIM7Q9NR12 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDLIM7Q9NR12 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDLIM7Q9NR12 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDLIM7Q9NR12 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDLIM7Q9NR12 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDLIM7Q9NR12 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDLIM7Q9NR12 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDLIM7Q9NR12 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDLIM7Q9NR12 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PDLIM7Q9NR12 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDLIM7Q9NR12 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDLIM7Q9NR12 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDLIM7Q9NR12 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDLIM7Q9NR12 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDLIM7Q9NR12 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDLIM7Q9NR12 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDLIM7Q9NR12 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDLIM7Q9NR12 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PDLIM7Q9NR12 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDLIM7Q9NR12 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDLIM7Q9NR12 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDLIM7Q9NR12 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDLIM7Q9NR12 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDLIM7Q9NR12 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDLIM7Q9NR12 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDLIM7Q9NR12 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDLIM7Q9NR12 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDLIM7Q9NR12 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDLIM7Q9NR12 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDLIM7Q9NR12 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDLIM7Q9NR12 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDLIM7Q9NR12 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDLIM7Q9NR12 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDLIM7Q9NR12 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDLIM7Q9NR12 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDLIM7Q9NR12 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDLIM7Q9NR12 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDLIM7Q9NR12 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDLIM7Q9NR12 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDLIM7Q9NR12 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDLIM7Q9NR12 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PDLIM7Q9NR12 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDLIM7Q9NR12 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDLIM7Q9NR12 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDLIM7Q9NR12 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDLIM7Q9NR12 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDLIM7Q9NR12 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDLIM7Q9NR12 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDLIM7Q9NR12 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDLIM7Q9NR12 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDLIM7Q9NR12 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PDLIM7Q9NR12 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PDLIM7Q9NR12 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PDLIM7Q9NR12 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDLIM7Q9NR12 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDLIM7Q9NR12 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PDLIM7Q9NR12 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
PDLIM7Q9NR12 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PDLIM7Q9NR12 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PDLIM7Q9NR12 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDLIM7Q9NR12 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PDLIM7Q9NR12 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PDLIM7Q9NR12 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PDLIM7Q9NR12 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PDLIM7Q9NR12 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDLIM7Q9NR12 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDLIM7Q9NR12 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDLIM7Q9NR12 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDLIM7Q9NR12 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDLIM7Q9NR12 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PDLIM7Q9NR12 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PDLIM7Q9NR12 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PDLIM7Q9NR12 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDLIM7Q9NR12 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDLIM7Q9NR12 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
PDLIM7Q9NR12 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PDLIM7Q9NR12 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PDLIM7Q9NR12 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDLIM7Q9NR12 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
PDLIM7Q9NR12 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PDLIM7Q9NR12 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDLIM7Q9NR12 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDLIM7Q9NR12 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDLIM7Q9NR12 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PDLIM7Q9NR12 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDLIM7Q9NR12 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDLIM7Q9NR12 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDLIM7Q9NR12 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDLIM7Q9NR12 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDLIM7Q9NR12 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDLIM7Q9NR12 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDLIM7Q9NR12 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDLIM7Q9NR12 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDLIM7Q9NR12 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDLIM7Q9NR12 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms