Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT5

EXOSC3, Exosome complex component RRP40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC3Q9NQT5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC3Q9NQT5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC3Q9NQT5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC3Q9NQT5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC3Q9NQT5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC3Q9NQT5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC3Q9NQT5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC3Q9NQT5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC3Q9NQT5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC3Q9NQT5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC3Q9NQT5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC3Q9NQT5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC3Q9NQT5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC3Q9NQT5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC3Q9NQT5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC3Q9NQT5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC3Q9NQT5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC3Q9NQT5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC3Q9NQT5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC3Q9NQT5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC3Q9NQT5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC3Q9NQT5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC3Q9NQT5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC3Q9NQT5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC3Q9NQT5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC3Q9NQT5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC3Q9NQT5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC3Q9NQT5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC3Q9NQT5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC3Q9NQT5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC3Q9NQT5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC3Q9NQT5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC3Q9NQT5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC3Q9NQT5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC3Q9NQT5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC3Q9NQT5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC3Q9NQT5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC3Q9NQT5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC3Q9NQT5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC3Q9NQT5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC3Q9NQT5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC3Q9NQT5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC3Q9NQT5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC3Q9NQT5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC3Q9NQT5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC3Q9NQT5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC3Q9NQT5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC3Q9NQT5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC3Q9NQT5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC3Q9NQT5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC3Q9NQT5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC3Q9NQT5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC3Q9NQT5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC3Q9NQT5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC3Q9NQT5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC3Q9NQT5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC3Q9NQT5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC3Q9NQT5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC3Q9NQT5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC3Q9NQT5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC3Q9NQT5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC3Q9NQT5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC3Q9NQT5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC3Q9NQT5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC3Q9NQT5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC3Q9NQT5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC3Q9NQT5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC3Q9NQT5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC3Q9NQT5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC3Q9NQT5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC3Q9NQT5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC3Q9NQT5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC3Q9NQT5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC3Q9NQT5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC3Q9NQT5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC3Q9NQT5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC3Q9NQT5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC3Q9NQT5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC3Q9NQT5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC3Q9NQT5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC3Q9NQT5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC3Q9NQT5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC3Q9NQT5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC3Q9NQT5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC3Q9NQT5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC3Q9NQT5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC3Q9NQT5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC3Q9NQT5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC3Q9NQT5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC3Q9NQT5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC3Q9NQT5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC3Q9NQT5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC3Q9NQT5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC3Q9NQT5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC3Q9NQT5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC3Q9NQT5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC3Q9NQT5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC3Q9NQT5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC3Q9NQT5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC3Q9NQT5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms