Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE2

NGRN, Neugrin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGRNQ9NPE2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NGRNQ9NPE2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NGRNQ9NPE2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NGRNQ9NPE2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NGRNQ9NPE2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NGRNQ9NPE2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NGRNQ9NPE2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NGRNQ9NPE2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NGRNQ9NPE2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NGRNQ9NPE2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NGRNQ9NPE2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NGRNQ9NPE2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NGRNQ9NPE2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NGRNQ9NPE2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NGRNQ9NPE2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NGRNQ9NPE2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NGRNQ9NPE2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NGRNQ9NPE2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NGRNQ9NPE2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NGRNQ9NPE2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NGRNQ9NPE2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NGRNQ9NPE2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NGRNQ9NPE2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NGRNQ9NPE2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NGRNQ9NPE2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NGRNQ9NPE2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NGRNQ9NPE2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NGRNQ9NPE2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NGRNQ9NPE2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NGRNQ9NPE2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NGRNQ9NPE2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NGRNQ9NPE2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NGRNQ9NPE2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NGRNQ9NPE2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NGRNQ9NPE2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NGRNQ9NPE2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NGRNQ9NPE2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NGRNQ9NPE2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NGRNQ9NPE2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NGRNQ9NPE2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NGRNQ9NPE2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NGRNQ9NPE2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NGRNQ9NPE2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NGRNQ9NPE2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NGRNQ9NPE2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NGRNQ9NPE2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NGRNQ9NPE2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NGRNQ9NPE2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NGRNQ9NPE2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NGRNQ9NPE2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NGRNQ9NPE2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NGRNQ9NPE2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NGRNQ9NPE2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NGRNQ9NPE2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NGRNQ9NPE2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NGRNQ9NPE2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NGRNQ9NPE2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NGRNQ9NPE2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NGRNQ9NPE2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NGRNQ9NPE2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NGRNQ9NPE2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NGRNQ9NPE2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NGRNQ9NPE2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NGRNQ9NPE2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NGRNQ9NPE2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NGRNQ9NPE2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NGRNQ9NPE2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NGRNQ9NPE2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NGRNQ9NPE2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NGRNQ9NPE2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NGRNQ9NPE2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NGRNQ9NPE2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NGRNQ9NPE2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NGRNQ9NPE2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NGRNQ9NPE2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NGRNQ9NPE2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NGRNQ9NPE2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NGRNQ9NPE2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NGRNQ9NPE2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NGRNQ9NPE2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NGRNQ9NPE2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NGRNQ9NPE2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NGRNQ9NPE2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NGRNQ9NPE2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NGRNQ9NPE2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NGRNQ9NPE2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NGRNQ9NPE2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NGRNQ9NPE2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NGRNQ9NPE2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NGRNQ9NPE2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NGRNQ9NPE2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NGRNQ9NPE2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NGRNQ9NPE2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NGRNQ9NPE2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NGRNQ9NPE2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NGRNQ9NPE2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NGRNQ9NPE2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NGRNQ9NPE2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NGRNQ9NPE2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NGRNQ9NPE2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms