Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GPCPD1Q9NPB8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GPCPD1Q9NPB8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GPCPD1Q9NPB8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GPCPD1Q9NPB8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GPCPD1Q9NPB8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GPCPD1Q9NPB8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GPCPD1Q9NPB8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GPCPD1Q9NPB8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GPCPD1Q9NPB8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GPCPD1Q9NPB8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GPCPD1Q9NPB8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GPCPD1Q9NPB8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GPCPD1Q9NPB8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GPCPD1Q9NPB8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GPCPD1Q9NPB8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPCPD1Q9NPB8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPCPD1Q9NPB8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPCPD1Q9NPB8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPCPD1Q9NPB8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPCPD1Q9NPB8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPCPD1Q9NPB8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPCPD1Q9NPB8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPCPD1Q9NPB8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPCPD1Q9NPB8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPCPD1Q9NPB8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPCPD1Q9NPB8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPCPD1Q9NPB8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPCPD1Q9NPB8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPCPD1Q9NPB8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPCPD1Q9NPB8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GPCPD1Q9NPB8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GPCPD1Q9NPB8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GPCPD1Q9NPB8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GPCPD1Q9NPB8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GPCPD1Q9NPB8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GPCPD1Q9NPB8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GPCPD1Q9NPB8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GPCPD1Q9NPB8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GPCPD1Q9NPB8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GPCPD1Q9NPB8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GPCPD1Q9NPB8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GPCPD1Q9NPB8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GPCPD1Q9NPB8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GPCPD1Q9NPB8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GPCPD1Q9NPB8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GPCPD1Q9NPB8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GPCPD1Q9NPB8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GPCPD1Q9NPB8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GPCPD1Q9NPB8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GPCPD1Q9NPB8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GPCPD1Q9NPB8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GPCPD1Q9NPB8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GPCPD1Q9NPB8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GPCPD1Q9NPB8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GPCPD1Q9NPB8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GPCPD1Q9NPB8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GPCPD1Q9NPB8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GPCPD1Q9NPB8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GPCPD1Q9NPB8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GPCPD1Q9NPB8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GPCPD1Q9NPB8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GPCPD1Q9NPB8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GPCPD1Q9NPB8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GPCPD1Q9NPB8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GPCPD1Q9NPB8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GPCPD1Q9NPB8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GPCPD1Q9NPB8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPCPD1Q9NPB8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPCPD1Q9NPB8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPCPD1Q9NPB8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPCPD1Q9NPB8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPCPD1Q9NPB8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPCPD1Q9NPB8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPCPD1Q9NPB8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
GPCPD1Q9NPB8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GPCPD1Q9NPB8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
GPCPD1Q9NPB8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GPCPD1Q9NPB8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GPCPD1Q9NPB8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GPCPD1Q9NPB8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GPCPD1Q9NPB8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GPCPD1Q9NPB8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GPCPD1Q9NPB8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GPCPD1Q9NPB8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GPCPD1Q9NPB8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GPCPD1Q9NPB8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPCPD1Q9NPB8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPCPD1Q9NPB8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPCPD1Q9NPB8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPCPD1Q9NPB8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPCPD1Q9NPB8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPCPD1Q9NPB8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPCPD1Q9NPB8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPCPD1Q9NPB8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPCPD1Q9NPB8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPCPD1Q9NPB8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GPCPD1Q9NPB8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GPCPD1Q9NPB8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GPCPD1Q9NPB8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms