Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB18Q9NP72 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB18Q9NP72 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB18Q9NP72 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB18Q9NP72 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB18Q9NP72 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB18Q9NP72 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB18Q9NP72 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB18Q9NP72 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB18Q9NP72 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB18Q9NP72 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB18Q9NP72 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB18Q9NP72 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB18Q9NP72 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB18Q9NP72 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB18Q9NP72 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB18Q9NP72 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB18Q9NP72 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB18Q9NP72 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB18Q9NP72 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB18Q9NP72 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB18Q9NP72 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB18Q9NP72 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB18Q9NP72 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB18Q9NP72 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB18Q9NP72 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB18Q9NP72 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB18Q9NP72 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB18Q9NP72 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB18Q9NP72 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB18Q9NP72 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB18Q9NP72 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB18Q9NP72 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB18Q9NP72 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB18Q9NP72 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB18Q9NP72 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB18Q9NP72 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB18Q9NP72 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB18Q9NP72 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB18Q9NP72 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB18Q9NP72 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB18Q9NP72 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB18Q9NP72 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB18Q9NP72 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB18Q9NP72 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB18Q9NP72 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB18Q9NP72 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB18Q9NP72 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB18Q9NP72 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB18Q9NP72 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB18Q9NP72 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB18Q9NP72 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB18Q9NP72 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB18Q9NP72 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB18Q9NP72 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB18Q9NP72 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB18Q9NP72 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB18Q9NP72 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB18Q9NP72 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB18Q9NP72 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB18Q9NP72 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB18Q9NP72 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB18Q9NP72 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB18Q9NP72 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB18Q9NP72 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB18Q9NP72 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB18Q9NP72 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB18Q9NP72 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB18Q9NP72 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB18Q9NP72 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB18Q9NP72 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB18Q9NP72 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB18Q9NP72 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB18Q9NP72 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB18Q9NP72 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB18Q9NP72 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB18Q9NP72 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB18Q9NP72 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB18Q9NP72 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB18Q9NP72 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB18Q9NP72 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB18Q9NP72 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB18Q9NP72 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB18Q9NP72 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB18Q9NP72 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB18Q9NP72 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB18Q9NP72 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB18Q9NP72 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB18Q9NP72 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB18Q9NP72 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB18Q9NP72 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB18Q9NP72 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB18Q9NP72 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB18Q9NP72 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB18Q9NP72 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB18Q9NP72 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB18Q9NP72 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB18Q9NP72 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB18Q9NP72 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB18Q9NP72 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms