Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ARFGAP3Q9NP61 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARFGAP3Q9NP61 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARFGAP3Q9NP61 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARFGAP3Q9NP61 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARFGAP3Q9NP61 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARFGAP3Q9NP61 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARFGAP3Q9NP61 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARFGAP3Q9NP61 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ARFGAP3Q9NP61 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARFGAP3Q9NP61 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARFGAP3Q9NP61 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARFGAP3Q9NP61 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARFGAP3Q9NP61 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ARFGAP3Q9NP61 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARFGAP3Q9NP61 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARFGAP3Q9NP61 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARFGAP3Q9NP61 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARFGAP3Q9NP61 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARFGAP3Q9NP61 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARFGAP3Q9NP61 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARFGAP3Q9NP61 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARFGAP3Q9NP61 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARFGAP3Q9NP61 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARFGAP3Q9NP61 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARFGAP3Q9NP61 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARFGAP3Q9NP61 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARFGAP3Q9NP61 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARFGAP3Q9NP61 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARFGAP3Q9NP61 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARFGAP3Q9NP61 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARFGAP3Q9NP61 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARFGAP3Q9NP61 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARFGAP3Q9NP61 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARFGAP3Q9NP61 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARFGAP3Q9NP61 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARFGAP3Q9NP61 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARFGAP3Q9NP61 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARFGAP3Q9NP61 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARFGAP3Q9NP61 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARFGAP3Q9NP61 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARFGAP3Q9NP61 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARFGAP3Q9NP61 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARFGAP3Q9NP61 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARFGAP3Q9NP61 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARFGAP3Q9NP61 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARFGAP3Q9NP61 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ARFGAP3Q9NP61 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARFGAP3Q9NP61 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARFGAP3Q9NP61 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARFGAP3Q9NP61 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARFGAP3Q9NP61 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARFGAP3Q9NP61 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARFGAP3Q9NP61 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARFGAP3Q9NP61 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARFGAP3Q9NP61 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARFGAP3Q9NP61 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARFGAP3Q9NP61 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARFGAP3Q9NP61 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARFGAP3Q9NP61 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARFGAP3Q9NP61 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARFGAP3Q9NP61 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARFGAP3Q9NP61 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARFGAP3Q9NP61 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARFGAP3Q9NP61 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARFGAP3Q9NP61 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ARFGAP3Q9NP61 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ARFGAP3Q9NP61 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARFGAP3Q9NP61 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ARFGAP3Q9NP61 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARFGAP3Q9NP61 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARFGAP3Q9NP61 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARFGAP3Q9NP61 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARFGAP3Q9NP61 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARFGAP3Q9NP61 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARFGAP3Q9NP61 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARFGAP3Q9NP61 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARFGAP3Q9NP61 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARFGAP3Q9NP61 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARFGAP3Q9NP61 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARFGAP3Q9NP61 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARFGAP3Q9NP61 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARFGAP3Q9NP61 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARFGAP3Q9NP61 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARFGAP3Q9NP61 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARFGAP3Q9NP61 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARFGAP3Q9NP61 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARFGAP3Q9NP61 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARFGAP3Q9NP61 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARFGAP3Q9NP61 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARFGAP3Q9NP61 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARFGAP3Q9NP61 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARFGAP3Q9NP61 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARFGAP3Q9NP61 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARFGAP3Q9NP61 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARFGAP3Q9NP61 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARFGAP3Q9NP61 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARFGAP3Q9NP61 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARFGAP3Q9NP61 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARFGAP3Q9NP61 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms