Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERVK-5Q9HDB9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERVK-5Q9HDB9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERVK-5Q9HDB9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERVK-5Q9HDB9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ERVK-5Q9HDB9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERVK-5Q9HDB9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERVK-5Q9HDB9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERVK-5Q9HDB9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERVK-5Q9HDB9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERVK-5Q9HDB9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERVK-5Q9HDB9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERVK-5Q9HDB9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERVK-5Q9HDB9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERVK-5Q9HDB9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERVK-5Q9HDB9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERVK-5Q9HDB9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERVK-5Q9HDB9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERVK-5Q9HDB9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERVK-5Q9HDB9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERVK-5Q9HDB9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ERVK-5Q9HDB9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ERVK-5Q9HDB9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERVK-5Q9HDB9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERVK-5Q9HDB9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERVK-5Q9HDB9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERVK-5Q9HDB9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ERVK-5Q9HDB9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ERVK-5Q9HDB9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ERVK-5Q9HDB9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ERVK-5Q9HDB9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ERVK-5Q9HDB9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ERVK-5Q9HDB9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ERVK-5Q9HDB9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERVK-5Q9HDB9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERVK-5Q9HDB9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERVK-5Q9HDB9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERVK-5Q9HDB9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERVK-5Q9HDB9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERVK-5Q9HDB9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERVK-5Q9HDB9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERVK-5Q9HDB9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERVK-5Q9HDB9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERVK-5Q9HDB9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERVK-5Q9HDB9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERVK-5Q9HDB9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERVK-5Q9HDB9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERVK-5Q9HDB9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERVK-5Q9HDB9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERVK-5Q9HDB9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERVK-5Q9HDB9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERVK-5Q9HDB9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERVK-5Q9HDB9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ERVK-5Q9HDB9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ERVK-5Q9HDB9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERVK-5Q9HDB9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERVK-5Q9HDB9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERVK-5Q9HDB9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERVK-5Q9HDB9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERVK-5Q9HDB9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERVK-5Q9HDB9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERVK-5Q9HDB9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERVK-5Q9HDB9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERVK-5Q9HDB9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERVK-5Q9HDB9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERVK-5Q9HDB9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERVK-5Q9HDB9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ERVK-5Q9HDB9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERVK-5Q9HDB9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ERVK-5Q9HDB9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERVK-5Q9HDB9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERVK-5Q9HDB9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERVK-5Q9HDB9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERVK-5Q9HDB9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERVK-5Q9HDB9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERVK-5Q9HDB9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERVK-5Q9HDB9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERVK-5Q9HDB9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERVK-5Q9HDB9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERVK-5Q9HDB9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERVK-5Q9HDB9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERVK-5Q9HDB9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERVK-5Q9HDB9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERVK-5Q9HDB9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERVK-5Q9HDB9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERVK-5Q9HDB9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ERVK-5Q9HDB9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERVK-5Q9HDB9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ERVK-5Q9HDB9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERVK-5Q9HDB9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERVK-5Q9HDB9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERVK-5Q9HDB9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ERVK-5Q9HDB9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERVK-5Q9HDB9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERVK-5Q9HDB9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERVK-5Q9HDB9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERVK-5Q9HDB9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERVK-5Q9HDB9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERVK-5Q9HDB9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERVK-5Q9HDB9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms