Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP4F12Q9HCS2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP4F12Q9HCS2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP4F12Q9HCS2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP4F12Q9HCS2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP4F12Q9HCS2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP4F12Q9HCS2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP4F12Q9HCS2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP4F12Q9HCS2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP4F12Q9HCS2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP4F12Q9HCS2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP4F12Q9HCS2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP4F12Q9HCS2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP4F12Q9HCS2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP4F12Q9HCS2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP4F12Q9HCS2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP4F12Q9HCS2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP4F12Q9HCS2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP4F12Q9HCS2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP4F12Q9HCS2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP4F12Q9HCS2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP4F12Q9HCS2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP4F12Q9HCS2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP4F12Q9HCS2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP4F12Q9HCS2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP4F12Q9HCS2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP4F12Q9HCS2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP4F12Q9HCS2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP4F12Q9HCS2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP4F12Q9HCS2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP4F12Q9HCS2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP4F12Q9HCS2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP4F12Q9HCS2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP4F12Q9HCS2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP4F12Q9HCS2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP4F12Q9HCS2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP4F12Q9HCS2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP4F12Q9HCS2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP4F12Q9HCS2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP4F12Q9HCS2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP4F12Q9HCS2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP4F12Q9HCS2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP4F12Q9HCS2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP4F12Q9HCS2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP4F12Q9HCS2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP4F12Q9HCS2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP4F12Q9HCS2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP4F12Q9HCS2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP4F12Q9HCS2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP4F12Q9HCS2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP4F12Q9HCS2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP4F12Q9HCS2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP4F12Q9HCS2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP4F12Q9HCS2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP4F12Q9HCS2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CYP4F12Q9HCS2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYP4F12Q9HCS2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYP4F12Q9HCS2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYP4F12Q9HCS2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CYP4F12Q9HCS2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYP4F12Q9HCS2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYP4F12Q9HCS2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYP4F12Q9HCS2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP4F12Q9HCS2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP4F12Q9HCS2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP4F12Q9HCS2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP4F12Q9HCS2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP4F12Q9HCS2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP4F12Q9HCS2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP4F12Q9HCS2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP4F12Q9HCS2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP4F12Q9HCS2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP4F12Q9HCS2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP4F12Q9HCS2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP4F12Q9HCS2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP4F12Q9HCS2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP4F12Q9HCS2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP4F12Q9HCS2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP4F12Q9HCS2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP4F12Q9HCS2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP4F12Q9HCS2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP4F12Q9HCS2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP4F12Q9HCS2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP4F12Q9HCS2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP4F12Q9HCS2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP4F12Q9HCS2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP4F12Q9HCS2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP4F12Q9HCS2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP4F12Q9HCS2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CYP4F12Q9HCS2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CYP4F12Q9HCS2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP4F12Q9HCS2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP4F12Q9HCS2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP4F12Q9HCS2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP4F12Q9HCS2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP4F12Q9HCS2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP4F12Q9HCS2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP4F12Q9HCS2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP4F12Q9HCS2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP4F12Q9HCS2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms