Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG4

ATP6V0A4, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 4, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V0A4Q9HBG4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP6V0A4Q9HBG4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP6V0A4Q9HBG4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATP6V0A4Q9HBG4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATP6V0A4Q9HBG4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATP6V0A4Q9HBG4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATP6V0A4Q9HBG4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATP6V0A4Q9HBG4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP6V0A4Q9HBG4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP6V0A4Q9HBG4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP6V0A4Q9HBG4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP6V0A4Q9HBG4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP6V0A4Q9HBG4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP6V0A4Q9HBG4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP6V0A4Q9HBG4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP6V0A4Q9HBG4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP6V0A4Q9HBG4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP6V0A4Q9HBG4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP6V0A4Q9HBG4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP6V0A4Q9HBG4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP6V0A4Q9HBG4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP6V0A4Q9HBG4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP6V0A4Q9HBG4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP6V0A4Q9HBG4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP6V0A4Q9HBG4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP6V0A4Q9HBG4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP6V0A4Q9HBG4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP6V0A4Q9HBG4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP6V0A4Q9HBG4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP6V0A4Q9HBG4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP6V0A4Q9HBG4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP6V0A4Q9HBG4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP6V0A4Q9HBG4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP6V0A4Q9HBG4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP6V0A4Q9HBG4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP6V0A4Q9HBG4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP6V0A4Q9HBG4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP6V0A4Q9HBG4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP6V0A4Q9HBG4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP6V0A4Q9HBG4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP6V0A4Q9HBG4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP6V0A4Q9HBG4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP6V0A4Q9HBG4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP6V0A4Q9HBG4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP6V0A4Q9HBG4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP6V0A4Q9HBG4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP6V0A4Q9HBG4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP6V0A4Q9HBG4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP6V0A4Q9HBG4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP6V0A4Q9HBG4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP6V0A4Q9HBG4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP6V0A4Q9HBG4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP6V0A4Q9HBG4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP6V0A4Q9HBG4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP6V0A4Q9HBG4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP6V0A4Q9HBG4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP6V0A4Q9HBG4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP6V0A4Q9HBG4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP6V0A4Q9HBG4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP6V0A4Q9HBG4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP6V0A4Q9HBG4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP6V0A4Q9HBG4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP6V0A4Q9HBG4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP6V0A4Q9HBG4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP6V0A4Q9HBG4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP6V0A4Q9HBG4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP6V0A4Q9HBG4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP6V0A4Q9HBG4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP6V0A4Q9HBG4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP6V0A4Q9HBG4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP6V0A4Q9HBG4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ATP6V0A4Q9HBG4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATP6V0A4Q9HBG4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP6V0A4Q9HBG4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP6V0A4Q9HBG4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP6V0A4Q9HBG4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP6V0A4Q9HBG4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP6V0A4Q9HBG4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP6V0A4Q9HBG4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP6V0A4Q9HBG4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP6V0A4Q9HBG4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP6V0A4Q9HBG4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP6V0A4Q9HBG4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP6V0A4Q9HBG4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP6V0A4Q9HBG4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP6V0A4Q9HBG4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP6V0A4Q9HBG4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP6V0A4Q9HBG4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP6V0A4Q9HBG4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP6V0A4Q9HBG4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP6V0A4Q9HBG4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP6V0A4Q9HBG4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP6V0A4Q9HBG4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP6V0A4Q9HBG4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP6V0A4Q9HBG4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP6V0A4Q9HBG4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP6V0A4Q9HBG4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP6V0A4Q9HBG4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP6V0A4Q9HBG4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP6V0A4Q9HBG4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms