Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2E6

SEMA6A, Semaphorin-6A, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6AQ9H2E6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA6AQ9H2E6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA6AQ9H2E6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA6AQ9H2E6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA6AQ9H2E6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA6AQ9H2E6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA6AQ9H2E6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA6AQ9H2E6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA6AQ9H2E6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA6AQ9H2E6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA6AQ9H2E6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA6AQ9H2E6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA6AQ9H2E6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA6AQ9H2E6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA6AQ9H2E6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA6AQ9H2E6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA6AQ9H2E6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA6AQ9H2E6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA6AQ9H2E6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA6AQ9H2E6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA6AQ9H2E6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA6AQ9H2E6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEMA6AQ9H2E6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEMA6AQ9H2E6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEMA6AQ9H2E6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA6AQ9H2E6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA6AQ9H2E6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA6AQ9H2E6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA6AQ9H2E6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA6AQ9H2E6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA6AQ9H2E6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA6AQ9H2E6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA6AQ9H2E6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA6AQ9H2E6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA6AQ9H2E6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA6AQ9H2E6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA6AQ9H2E6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA6AQ9H2E6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA6AQ9H2E6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA6AQ9H2E6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA6AQ9H2E6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA6AQ9H2E6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA6AQ9H2E6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA6AQ9H2E6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA6AQ9H2E6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA6AQ9H2E6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA6AQ9H2E6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA6AQ9H2E6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA6AQ9H2E6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA6AQ9H2E6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA6AQ9H2E6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA6AQ9H2E6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA6AQ9H2E6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA6AQ9H2E6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA6AQ9H2E6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA6AQ9H2E6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA6AQ9H2E6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA6AQ9H2E6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA6AQ9H2E6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA6AQ9H2E6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA6AQ9H2E6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA6AQ9H2E6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA6AQ9H2E6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA6AQ9H2E6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA6AQ9H2E6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA6AQ9H2E6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA6AQ9H2E6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA6AQ9H2E6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA6AQ9H2E6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA6AQ9H2E6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA6AQ9H2E6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SEMA6AQ9H2E6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA6AQ9H2E6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA6AQ9H2E6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA6AQ9H2E6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA6AQ9H2E6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA6AQ9H2E6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA6AQ9H2E6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA6AQ9H2E6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA6AQ9H2E6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA6AQ9H2E6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA6AQ9H2E6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA6AQ9H2E6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA6AQ9H2E6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA6AQ9H2E6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA6AQ9H2E6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA6AQ9H2E6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA6AQ9H2E6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA6AQ9H2E6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA6AQ9H2E6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA6AQ9H2E6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA6AQ9H2E6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA6AQ9H2E6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA6AQ9H2E6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA6AQ9H2E6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA6AQ9H2E6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA6AQ9H2E6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA6AQ9H2E6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA6AQ9H2E6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA6AQ9H2E6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms