Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0U6

MRPL18, 39S ribosomal protein L18, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL18Q9H0U6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MRPL18Q9H0U6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL18Q9H0U6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL18Q9H0U6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL18Q9H0U6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL18Q9H0U6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL18Q9H0U6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL18Q9H0U6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL18Q9H0U6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL18Q9H0U6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL18Q9H0U6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL18Q9H0U6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL18Q9H0U6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL18Q9H0U6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL18Q9H0U6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL18Q9H0U6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL18Q9H0U6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL18Q9H0U6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL18Q9H0U6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL18Q9H0U6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL18Q9H0U6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL18Q9H0U6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL18Q9H0U6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL18Q9H0U6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRPL18Q9H0U6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRPL18Q9H0U6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRPL18Q9H0U6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRPL18Q9H0U6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRPL18Q9H0U6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRPL18Q9H0U6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRPL18Q9H0U6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRPL18Q9H0U6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRPL18Q9H0U6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRPL18Q9H0U6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRPL18Q9H0U6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MRPL18Q9H0U6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MRPL18Q9H0U6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MRPL18Q9H0U6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MRPL18Q9H0U6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MRPL18Q9H0U6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MRPL18Q9H0U6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MRPL18Q9H0U6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms