Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0L4

CSTF2T, Cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF2TQ9H0L4 SELENOF-205ENST00000469566 831 ntTSL 28.99□□□□□ -0.974e-9■■■■■ 29.8
CSTF2TQ9H0L4 KCNJ10-204ENST00000637644 1239 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.034e-9■■■■■ 29.8
CSTF2TQ9H0L4 KCNJ10-210ENST00000640914 565 ntTSL 57.91□□□□□ -1.144e-9■■■■■ 29.8
CSTF2TQ9H0L4 SELENOF-204ENST00000467557 499 ntTSL 57.06□□□□□ -1.284e-9■■■■■ 29.8
CSTF2TQ9H0L4 SELENOF-206ENST00000497861 266 ntTSL 34.06□□□□□ -1.764e-9■■■■■ 29.8
CSTF2TQ9H0L4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.851e-7■■■■■ 29.8
CSTF2TQ9H0L4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.741e-7■■■■■ 29.8
CSTF2TQ9H0L4 CORO1C-201ENST00000261401 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.642e-10■■■■■ 29.8
CSTF2TQ9H0L4 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.15e-8■■■■■ 29.8
CSTF2TQ9H0L4 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.185e-8■■■■■ 29.8
CSTF2TQ9H0L4 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.385e-8■■■■■ 29.8
CSTF2TQ9H0L4 AC023509.3-202ENST00000591834 1609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.485e-8■■■■■ 29.8
CSTF2TQ9H0L4 ATF7-210ENST00000588232 531 ntTSL 410.44□□□□□ -0.745e-8■■■■■ 29.8
CSTF2TQ9H0L4 ATF7-202ENST00000456903 5218 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.95e-8■■■■■ 29.8
CSTF2TQ9H0L4 ATF7-201ENST00000420353 6680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.945e-8■■■■■ 29.8
CSTF2TQ9H0L4 ATF7-209ENST00000588078 531 ntTSL 58.03□□□□□ -1.125e-8■■■■■ 29.8
CSTF2TQ9H0L4 ATF7-208ENST00000551480 473 ntTSL 56.26□□□□□ -1.415e-8■■■■■ 29.8
CSTF2TQ9H0L4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.572e-7■■■■■ 29.7
CSTF2TQ9H0L4 CORO1C-217ENST00000551550 547 ntTSL 48.99□□□□□ -0.972e-10■■■■■ 29.7
CSTF2TQ9H0L4 ZNF160-207ENST00000597112 1728 ntTSL 215.02□□□□□ -0.018e-8■■■■■ 29.7
CSTF2TQ9H0L4 ZNF160-210ENST00000599637 565 ntTSL 414.88□□□□□ -0.038e-8■■■■■ 29.7
CSTF2TQ9H0L4 ZNF160-216ENST00000602095 617 ntTSL 314.17□□□□□ -0.148e-8■■■■■ 29.7
CSTF2TQ9H0L4 ZNF160-212ENST00000599980 750 ntTSL 213.37□□□□□ -0.278e-8■■■■■ 29.7
CSTF2TQ9H0L4 ZNF160-206ENST00000596966 583 ntTSL 312.93□□□□□ -0.348e-8■■■■■ 29.7
CSTF2TQ9H0L4 ZNF160-213ENST00000600924 605 ntTSL 410.57□□□□□ -0.728e-8■■■■■ 29.7
CSTF2TQ9H0L4 ZNF160-201ENST00000355147 1304 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.998e-8■■■■■ 29.7
CSTF2TQ9H0L4 ZNF160-204ENST00000594760 549 ntTSL 48.22□□□□□ -1.098e-8■■■■■ 29.7
CSTF2TQ9H0L4 ZNF160-208ENST00000599056 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.278e-8■■■■■ 29.7
CSTF2TQ9H0L4 ZNF160-209ENST00000599247 1926 ntTSL 1 (best)6.75□□□□□ -1.338e-8■■■■■ 29.7
CSTF2TQ9H0L4 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.348e-8■■■■■ 29.7
CSTF2TQ9H0L4 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.538e-8■■■■■ 29.7
CSTF2TQ9H0L4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.18■■□□□ 1.787e-8■■■■■ 29.7
CSTF2TQ9H0L4 KCNIP2-213ENST00000483385 736 ntTSL 317.44■□□□□ 0.381e-10■■■■■ 29.6
CSTF2TQ9H0L4 ZNF827-201ENST00000379448 4197 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.624e-7■■■■■ 29.6
CSTF2TQ9H0L4 ZNF827-208ENST00000513320 3165 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.924e-7■■■■■ 29.6
CSTF2TQ9H0L4 ZNF827-203ENST00000508784 7463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.154e-7■■■■■ 29.6
CSTF2TQ9H0L4 CORO1C-216ENST00000551059 474 ntTSL 217.48■□□□□ 0.392e-10■■■■■ 29.6
CSTF2TQ9H0L4 CORO1C-214ENST00000550542 1245 ntTSL 517.18■□□□□ 0.342e-10■■■■■ 29.6
CSTF2TQ9H0L4 CORO1C-219ENST00000552871 587 ntTSL 317.18■□□□□ 0.342e-10■■■■■ 29.6
CSTF2TQ9H0L4 CORO1C-210ENST00000549384 891 ntTSL 516.93■□□□□ 0.32e-10■■■■■ 29.6
CSTF2TQ9H0L4 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.158e-8■■■■■ 29.6
CSTF2TQ9H0L4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.79e-9■■■■■ 29.6
CSTF2TQ9H0L4 WEE1-201ENST00000299613 3436 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.689e-9■■■■■ 29.6
CSTF2TQ9H0L4 WEE1-203ENST00000524549 5187 ntTSL 26.93□□□□□ -1.39e-9■■■■■ 29.6
CSTF2TQ9H0L4 WEE1-204ENST00000524612 573 ntTSL 45.96□□□□□ -1.469e-9■■■■■ 29.6
CSTF2TQ9H0L4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.57e-7■■■■■ 29.6
CSTF2TQ9H0L4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.635e-7■■■■■ 29.5
CSTF2TQ9H0L4 CDK6-201ENST00000265734 11612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.85e-7■■■■■ 29.5
CSTF2TQ9H0L4 C8orf82-204ENST00000532827 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 221.51■■□□□ 1.032e-9■■■■■ 29.5
CSTF2TQ9H0L4 GNAS-256ENST00000603546 573 ntTSL 525.73■■□□□ 1.714e-11■■■■■ 29.5
CSTF2TQ9H0L4 AC003006.1-201ENST00000599221 421 ntTSL 313.04□□□□□ -0.328e-17■■■■■ 29.4
CSTF2TQ9H0L4 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.368e-17■■■■■ 29.4
CSTF2TQ9H0L4 PPP2R5C-212ENST00000554442 800 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.875e-8■■■■■ 29.4
CSTF2TQ9H0L4 PPP2R5C-215ENST00000556068 3363 ntTSL 26.2□□□□□ -1.425e-8■■■■■ 29.4
CSTF2TQ9H0L4 AL513164.1-201ENST00000423268 311 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.213e-6■■■■■ 29.4
CSTF2TQ9H0L4 NPHP4-209ENST00000489180 5548 ntTSL 216.7■□□□□ 0.265e-7■■■■■ 29.4
CSTF2TQ9H0L4 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.065e-7■■■■■ 29.4
CSTF2TQ9H0L4 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.145e-7■■■■■ 29.4
CSTF2TQ9H0L4 NPHP4-208ENST00000478423 4467 ntTSL 213.37□□□□□ -0.275e-7■■■■■ 29.4
CSTF2TQ9H0L4 NPHP4-203ENST00000378169 4213 ntTSL 1 (best)12.26□□□□□ -0.455e-7■■■■■ 29.4
CSTF2TQ9H0L4 TBC1D22A-208ENST00000441936 590 ntTSL 419.72■□□□□ 0.756e-9■■■■■ 29.4
CSTF2TQ9H0L4 TBC1D22A-211ENST00000496139 530 ntTSL 419.67■□□□□ 0.746e-9■■■■■ 29.4
CSTF2TQ9H0L4 TBC1D22A-210ENST00000486163 513 ntTSL 419.39■□□□□ 0.696e-9■■■■■ 29.4
CSTF2TQ9H0L4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.496e-9■■■■■ 29.4
CSTF2TQ9H0L4 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.36e-9■■■■■ 29.4
CSTF2TQ9H0L4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.276e-9■■■■■ 29.4
CSTF2TQ9H0L4 TBC1D22A-209ENST00000472791 558 ntTSL 415.75■□□□□ 0.116e-9■■■■■ 29.4
CSTF2TQ9H0L4 STXBP2-215ENST00000599558 385 ntTSL 214.99□□□□□ -0.016e-9■■■■■ 29.4
CSTF2TQ9H0L4 APMAP-202ENST00000451442 2117 ntTSL 512.34□□□□□ -0.436e-9■■■■■ 29.4
CSTF2TQ9H0L4 CYB5R3-202ENST00000361740 2938 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.616e-9■■■■■ 29.4
CSTF2TQ9H0L4 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.626e-9■■■■■ 29.4
CSTF2TQ9H0L4 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.646e-9■■■■■ 29.4
CSTF2TQ9H0L4 RER1-201ENST00000306256 695 ntTSL 519.41■□□□□ 0.73e-7■■■■■ 29.4
CSTF2TQ9H0L4 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.123e-7■■■■■ 29.4
CSTF2TQ9H0L4 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.033e-7■■■■■ 29.4
CSTF2TQ9H0L4 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.143e-7■■■■■ 29.4
CSTF2TQ9H0L4 MAPK8-212ENST00000469110 3595 ntTSL 1 (best)7.24□□□□□ -1.255e-8■■■■■ 29.3
CSTF2TQ9H0L4 ABR-209ENST00000571022 551 ntTSL 44.55□□□□□ -1.688e-7■■■■■ 29.3
CSTF2TQ9H0L4 LIG4-204ENST00000611712 4180 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.02□□□□□ -1.139e-8■■■■■ 29.3
CSTF2TQ9H0L4 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.929e-8■■■■■ 29.3
CSTF2TQ9H0L4 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.979e-8■■■■■ 29.3
CSTF2TQ9H0L4 BAIAP2L1-204ENST00000479789 521 ntTSL 38.58□□□□□ -1.042e-8■■■■■ 29.3
CSTF2TQ9H0L4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.515e-10■■■■■ 29.3
CSTF2TQ9H0L4 EVI5-207ENST00000492613 495 ntTSL 35.4□□□□□ -1.541e-8■■■■■ 29.2
CSTF2TQ9H0L4 EVI5-205ENST00000491940 971 ntTSL 54.15□□□□□ -1.751e-8■■■■■ 29.2
CSTF2TQ9H0L4 EVI5-203ENST00000468580 654 ntTSL 53.96□□□□□ -1.781e-8■■■■■ 29.2
CSTF2TQ9H0L4 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.81e-8■■■■■ 29.2
CSTF2TQ9H0L4 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.851e-8■■■■■ 29.2
CSTF2TQ9H0L4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.315e-7■■■■■ 29.2
CSTF2TQ9H0L4 PRKCB-210ENST00000498739 569 ntTSL 415.59■□□□□ 0.095e-7■■■■■ 29.2
CSTF2TQ9H0L4 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.295e-7■■■■■ 29.2
CSTF2TQ9H0L4 NUMBL-206ENST00000598773 834 ntTSL 520.59■□□□□ 0.891e-6■■■■■ 29.2
CSTF2TQ9H0L4 CSNK1G2-209ENST00000591752 648 ntTSL 516.02■□□□□ 0.163e-8■■■■■ 29.2
CSTF2TQ9H0L4 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.221e-7■■■■■ 29.2
CSTF2TQ9H0L4 PPP2R5C-227ENST00000557268 2013 ntTSL 212.67□□□□□ -0.381e-7■■■■■ 29.2
CSTF2TQ9H0L4 PPP2R5C-201ENST00000328724 4045 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.011e-7■■■■■ 29.2
CSTF2TQ9H0L4 SETD1A-202ENST00000452917 315 ntTSL 220.71■□□□□ 0.912e-8■■■■■ 29.2
CSTF2TQ9H0L4 AP3D1-208ENST00000590683 723 ntTSL 58.36□□□□□ -1.077e-7■■■■■ 29.2
CSTF2TQ9H0L4 SMG7-205ENST00000440812 1190 ntTSL 519.79■□□□□ 0.762e-7■■■■■ 29.2
CSTF2TQ9H0L4 SMG7-203ENST00000367538 328 ntTSL 217.65■□□□□ 0.422e-7■■■■■ 29.2
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