Protein–RNA interactions for Protein: Q9H082

RAB33B, Ras-related protein Rab-33B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB33BQ9H082 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB33BQ9H082 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB33BQ9H082 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB33BQ9H082 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB33BQ9H082 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB33BQ9H082 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB33BQ9H082 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB33BQ9H082 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB33BQ9H082 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB33BQ9H082 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB33BQ9H082 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB33BQ9H082 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB33BQ9H082 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB33BQ9H082 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB33BQ9H082 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB33BQ9H082 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB33BQ9H082 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB33BQ9H082 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB33BQ9H082 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB33BQ9H082 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB33BQ9H082 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB33BQ9H082 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB33BQ9H082 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB33BQ9H082 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB33BQ9H082 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB33BQ9H082 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB33BQ9H082 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB33BQ9H082 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB33BQ9H082 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB33BQ9H082 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB33BQ9H082 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB33BQ9H082 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB33BQ9H082 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB33BQ9H082 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB33BQ9H082 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB33BQ9H082 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB33BQ9H082 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB33BQ9H082 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB33BQ9H082 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB33BQ9H082 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB33BQ9H082 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB33BQ9H082 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB33BQ9H082 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB33BQ9H082 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB33BQ9H082 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB33BQ9H082 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB33BQ9H082 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB33BQ9H082 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB33BQ9H082 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB33BQ9H082 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB33BQ9H082 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB33BQ9H082 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB33BQ9H082 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB33BQ9H082 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB33BQ9H082 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB33BQ9H082 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB33BQ9H082 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB33BQ9H082 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB33BQ9H082 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB33BQ9H082 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB33BQ9H082 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB33BQ9H082 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB33BQ9H082 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB33BQ9H082 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB33BQ9H082 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB33BQ9H082 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB33BQ9H082 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB33BQ9H082 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB33BQ9H082 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB33BQ9H082 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB33BQ9H082 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB33BQ9H082 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB33BQ9H082 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB33BQ9H082 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB33BQ9H082 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB33BQ9H082 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB33BQ9H082 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB33BQ9H082 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB33BQ9H082 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB33BQ9H082 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB33BQ9H082 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB33BQ9H082 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB33BQ9H082 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB33BQ9H082 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB33BQ9H082 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB33BQ9H082 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB33BQ9H082 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB33BQ9H082 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB33BQ9H082 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB33BQ9H082 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB33BQ9H082 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB33BQ9H082 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB33BQ9H082 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB33BQ9H082 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB33BQ9H082 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB33BQ9H082 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB33BQ9H082 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB33BQ9H082 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB33BQ9H082 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB33BQ9H082 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms