Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ6

CHRNA10, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA10Q9GZZ6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA10Q9GZZ6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA10Q9GZZ6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA10Q9GZZ6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA10Q9GZZ6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA10Q9GZZ6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA10Q9GZZ6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA10Q9GZZ6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA10Q9GZZ6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA10Q9GZZ6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA10Q9GZZ6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA10Q9GZZ6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA10Q9GZZ6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA10Q9GZZ6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA10Q9GZZ6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA10Q9GZZ6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA10Q9GZZ6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA10Q9GZZ6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA10Q9GZZ6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA10Q9GZZ6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA10Q9GZZ6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA10Q9GZZ6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA10Q9GZZ6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA10Q9GZZ6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA10Q9GZZ6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA10Q9GZZ6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA10Q9GZZ6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA10Q9GZZ6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA10Q9GZZ6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA10Q9GZZ6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA10Q9GZZ6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA10Q9GZZ6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA10Q9GZZ6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA10Q9GZZ6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA10Q9GZZ6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA10Q9GZZ6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNA10Q9GZZ6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNA10Q9GZZ6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNA10Q9GZZ6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA10Q9GZZ6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA10Q9GZZ6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA10Q9GZZ6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA10Q9GZZ6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA10Q9GZZ6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA10Q9GZZ6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA10Q9GZZ6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA10Q9GZZ6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA10Q9GZZ6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA10Q9GZZ6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA10Q9GZZ6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA10Q9GZZ6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA10Q9GZZ6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA10Q9GZZ6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA10Q9GZZ6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA10Q9GZZ6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA10Q9GZZ6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA10Q9GZZ6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA10Q9GZZ6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA10Q9GZZ6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA10Q9GZZ6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA10Q9GZZ6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA10Q9GZZ6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA10Q9GZZ6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA10Q9GZZ6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA10Q9GZZ6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA10Q9GZZ6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA10Q9GZZ6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA10Q9GZZ6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA10Q9GZZ6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA10Q9GZZ6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA10Q9GZZ6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA10Q9GZZ6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA10Q9GZZ6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA10Q9GZZ6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA10Q9GZZ6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNA10Q9GZZ6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNA10Q9GZZ6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNA10Q9GZZ6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNA10Q9GZZ6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNA10Q9GZZ6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNA10Q9GZZ6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNA10Q9GZZ6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNA10Q9GZZ6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNA10Q9GZZ6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNA10Q9GZZ6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNA10Q9GZZ6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNA10Q9GZZ6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNA10Q9GZZ6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNA10Q9GZZ6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNA10Q9GZZ6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNA10Q9GZZ6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNA10Q9GZZ6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA10Q9GZZ6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA10Q9GZZ6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA10Q9GZZ6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA10Q9GZZ6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA10Q9GZZ6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNA10Q9GZZ6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNA10Q9GZZ6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNA10Q9GZZ6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms