Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTDSP1Q9GZU7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTDSP1Q9GZU7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CTDSP1Q9GZU7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTDSP1Q9GZU7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTDSP1Q9GZU7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTDSP1Q9GZU7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTDSP1Q9GZU7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTDSP1Q9GZU7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTDSP1Q9GZU7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTDSP1Q9GZU7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTDSP1Q9GZU7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTDSP1Q9GZU7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTDSP1Q9GZU7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTDSP1Q9GZU7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTDSP1Q9GZU7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTDSP1Q9GZU7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTDSP1Q9GZU7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTDSP1Q9GZU7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTDSP1Q9GZU7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTDSP1Q9GZU7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTDSP1Q9GZU7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTDSP1Q9GZU7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTDSP1Q9GZU7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTDSP1Q9GZU7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTDSP1Q9GZU7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTDSP1Q9GZU7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTDSP1Q9GZU7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTDSP1Q9GZU7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSP1Q9GZU7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSP1Q9GZU7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSP1Q9GZU7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSP1Q9GZU7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSP1Q9GZU7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSP1Q9GZU7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSP1Q9GZU7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSP1Q9GZU7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSP1Q9GZU7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSP1Q9GZU7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSP1Q9GZU7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSP1Q9GZU7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSP1Q9GZU7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSP1Q9GZU7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSP1Q9GZU7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSP1Q9GZU7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSP1Q9GZU7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTDSP1Q9GZU7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTDSP1Q9GZU7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSP1Q9GZU7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSP1Q9GZU7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSP1Q9GZU7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSP1Q9GZU7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSP1Q9GZU7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSP1Q9GZU7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSP1Q9GZU7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTDSP1Q9GZU7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTDSP1Q9GZU7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTDSP1Q9GZU7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTDSP1Q9GZU7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTDSP1Q9GZU7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTDSP1Q9GZU7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTDSP1Q9GZU7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTDSP1Q9GZU7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTDSP1Q9GZU7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTDSP1Q9GZU7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CTDSP1Q9GZU7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSP1Q9GZU7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSP1Q9GZU7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSP1Q9GZU7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSP1Q9GZU7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSP1Q9GZU7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSP1Q9GZU7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSP1Q9GZU7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSP1Q9GZU7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSP1Q9GZU7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTDSP1Q9GZU7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTDSP1Q9GZU7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTDSP1Q9GZU7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTDSP1Q9GZU7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTDSP1Q9GZU7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTDSP1Q9GZU7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTDSP1Q9GZU7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTDSP1Q9GZU7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTDSP1Q9GZU7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTDSP1Q9GZU7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTDSP1Q9GZU7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTDSP1Q9GZU7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTDSP1Q9GZU7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTDSP1Q9GZU7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTDSP1Q9GZU7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTDSP1Q9GZU7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTDSP1Q9GZU7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTDSP1Q9GZU7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTDSP1Q9GZU7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTDSP1Q9GZU7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTDSP1Q9GZU7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTDSP1Q9GZU7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTDSP1Q9GZU7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTDSP1Q9GZU7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTDSP1Q9GZU7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms