Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BCO2Q9BYV7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BCO2Q9BYV7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BCO2Q9BYV7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BCO2Q9BYV7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BCO2Q9BYV7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BCO2Q9BYV7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BCO2Q9BYV7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BCO2Q9BYV7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BCO2Q9BYV7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BCO2Q9BYV7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
BCO2Q9BYV7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BCO2Q9BYV7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BCO2Q9BYV7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BCO2Q9BYV7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BCO2Q9BYV7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BCO2Q9BYV7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BCO2Q9BYV7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BCO2Q9BYV7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BCO2Q9BYV7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
BCO2Q9BYV7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
BCO2Q9BYV7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BCO2Q9BYV7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BCO2Q9BYV7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BCO2Q9BYV7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BCO2Q9BYV7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BCO2Q9BYV7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BCO2Q9BYV7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
BCO2Q9BYV7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BCO2Q9BYV7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BCO2Q9BYV7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BCO2Q9BYV7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BCO2Q9BYV7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BCO2Q9BYV7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
BCO2Q9BYV7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
BCO2Q9BYV7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BCO2Q9BYV7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BCO2Q9BYV7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BCO2Q9BYV7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BCO2Q9BYV7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BCO2Q9BYV7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BCO2Q9BYV7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BCO2Q9BYV7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BCO2Q9BYV7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BCO2Q9BYV7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BCO2Q9BYV7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
BCO2Q9BYV7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BCO2Q9BYV7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BCO2Q9BYV7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BCO2Q9BYV7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BCO2Q9BYV7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BCO2Q9BYV7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BCO2Q9BYV7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BCO2Q9BYV7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BCO2Q9BYV7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BCO2Q9BYV7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BCO2Q9BYV7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BCO2Q9BYV7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BCO2Q9BYV7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BCO2Q9BYV7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BCO2Q9BYV7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BCO2Q9BYV7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BCO2Q9BYV7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BCO2Q9BYV7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
BCO2Q9BYV7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BCO2Q9BYV7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
BCO2Q9BYV7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BCO2Q9BYV7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BCO2Q9BYV7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BCO2Q9BYV7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BCO2Q9BYV7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BCO2Q9BYV7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BCO2Q9BYV7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BCO2Q9BYV7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BCO2Q9BYV7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BCO2Q9BYV7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BCO2Q9BYV7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BCO2Q9BYV7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BCO2Q9BYV7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BCO2Q9BYV7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
BCO2Q9BYV7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BCO2Q9BYV7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
BCO2Q9BYV7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BCO2Q9BYV7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BCO2Q9BYV7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BCO2Q9BYV7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BCO2Q9BYV7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BCO2Q9BYV7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BCO2Q9BYV7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BCO2Q9BYV7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BCO2Q9BYV7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BCO2Q9BYV7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BCO2Q9BYV7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BCO2Q9BYV7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BCO2Q9BYV7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BCO2Q9BYV7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
BCO2Q9BYV7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
BCO2Q9BYV7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BCO2Q9BYV7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BCO2Q9BYV7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms