Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWJ5

SF3B5, Splicing factor 3B subunit 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B5Q9BWJ5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SF3B5Q9BWJ5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SF3B5Q9BWJ5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SF3B5Q9BWJ5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SF3B5Q9BWJ5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SF3B5Q9BWJ5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SF3B5Q9BWJ5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SF3B5Q9BWJ5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SF3B5Q9BWJ5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SF3B5Q9BWJ5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SF3B5Q9BWJ5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SF3B5Q9BWJ5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SF3B5Q9BWJ5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SF3B5Q9BWJ5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SF3B5Q9BWJ5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SF3B5Q9BWJ5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SF3B5Q9BWJ5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SF3B5Q9BWJ5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SF3B5Q9BWJ5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SF3B5Q9BWJ5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SF3B5Q9BWJ5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SF3B5Q9BWJ5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SF3B5Q9BWJ5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SF3B5Q9BWJ5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SF3B5Q9BWJ5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SF3B5Q9BWJ5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SF3B5Q9BWJ5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SF3B5Q9BWJ5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SF3B5Q9BWJ5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SF3B5Q9BWJ5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SF3B5Q9BWJ5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SF3B5Q9BWJ5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SF3B5Q9BWJ5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SF3B5Q9BWJ5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SF3B5Q9BWJ5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SF3B5Q9BWJ5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SF3B5Q9BWJ5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3B5Q9BWJ5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3B5Q9BWJ5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3B5Q9BWJ5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3B5Q9BWJ5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3B5Q9BWJ5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3B5Q9BWJ5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3B5Q9BWJ5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SF3B5Q9BWJ5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SF3B5Q9BWJ5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SF3B5Q9BWJ5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SF3B5Q9BWJ5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SF3B5Q9BWJ5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SF3B5Q9BWJ5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SF3B5Q9BWJ5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SF3B5Q9BWJ5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SF3B5Q9BWJ5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SF3B5Q9BWJ5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SF3B5Q9BWJ5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SF3B5Q9BWJ5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SF3B5Q9BWJ5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SF3B5Q9BWJ5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SF3B5Q9BWJ5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SF3B5Q9BWJ5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SF3B5Q9BWJ5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SF3B5Q9BWJ5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SF3B5Q9BWJ5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SF3B5Q9BWJ5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SF3B5Q9BWJ5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SF3B5Q9BWJ5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SF3B5Q9BWJ5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SF3B5Q9BWJ5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SF3B5Q9BWJ5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SF3B5Q9BWJ5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SF3B5Q9BWJ5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SF3B5Q9BWJ5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SF3B5Q9BWJ5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3B5Q9BWJ5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3B5Q9BWJ5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3B5Q9BWJ5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3B5Q9BWJ5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3B5Q9BWJ5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SF3B5Q9BWJ5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SF3B5Q9BWJ5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SF3B5Q9BWJ5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SF3B5Q9BWJ5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SF3B5Q9BWJ5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SF3B5Q9BWJ5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SF3B5Q9BWJ5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SF3B5Q9BWJ5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SF3B5Q9BWJ5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SF3B5Q9BWJ5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SF3B5Q9BWJ5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SF3B5Q9BWJ5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SF3B5Q9BWJ5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SF3B5Q9BWJ5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SF3B5Q9BWJ5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SF3B5Q9BWJ5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SF3B5Q9BWJ5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SF3B5Q9BWJ5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SF3B5Q9BWJ5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SF3B5Q9BWJ5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SF3B5Q9BWJ5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SF3B5Q9BWJ5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1530.7 ms