Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT88

SYT11, Synaptotagmin-11, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT11Q9BT88 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYT11Q9BT88 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYT11Q9BT88 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYT11Q9BT88 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYT11Q9BT88 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYT11Q9BT88 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYT11Q9BT88 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYT11Q9BT88 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYT11Q9BT88 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SYT11Q9BT88 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYT11Q9BT88 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SYT11Q9BT88 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYT11Q9BT88 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT11Q9BT88 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT11Q9BT88 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT11Q9BT88 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT11Q9BT88 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT11Q9BT88 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT11Q9BT88 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT11Q9BT88 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT11Q9BT88 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYT11Q9BT88 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYT11Q9BT88 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYT11Q9BT88 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYT11Q9BT88 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYT11Q9BT88 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYT11Q9BT88 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYT11Q9BT88 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYT11Q9BT88 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYT11Q9BT88 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SYT11Q9BT88 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYT11Q9BT88 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYT11Q9BT88 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYT11Q9BT88 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYT11Q9BT88 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYT11Q9BT88 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYT11Q9BT88 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SYT11Q9BT88 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYT11Q9BT88 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYT11Q9BT88 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SYT11Q9BT88 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYT11Q9BT88 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYT11Q9BT88 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYT11Q9BT88 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYT11Q9BT88 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYT11Q9BT88 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYT11Q9BT88 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYT11Q9BT88 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYT11Q9BT88 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYT11Q9BT88 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYT11Q9BT88 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYT11Q9BT88 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYT11Q9BT88 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYT11Q9BT88 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYT11Q9BT88 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYT11Q9BT88 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYT11Q9BT88 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SYT11Q9BT88 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYT11Q9BT88 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYT11Q9BT88 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYT11Q9BT88 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYT11Q9BT88 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYT11Q9BT88 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYT11Q9BT88 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYT11Q9BT88 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYT11Q9BT88 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYT11Q9BT88 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYT11Q9BT88 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYT11Q9BT88 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYT11Q9BT88 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYT11Q9BT88 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYT11Q9BT88 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYT11Q9BT88 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYT11Q9BT88 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SYT11Q9BT88 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SYT11Q9BT88 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYT11Q9BT88 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYT11Q9BT88 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYT11Q9BT88 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYT11Q9BT88 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYT11Q9BT88 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYT11Q9BT88 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYT11Q9BT88 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYT11Q9BT88 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYT11Q9BT88 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SYT11Q9BT88 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYT11Q9BT88 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYT11Q9BT88 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYT11Q9BT88 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYT11Q9BT88 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYT11Q9BT88 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYT11Q9BT88 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYT11Q9BT88 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYT11Q9BT88 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SYT11Q9BT88 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SYT11Q9BT88 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYT11Q9BT88 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYT11Q9BT88 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYT11Q9BT88 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYT11Q9BT88 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms