Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C2orf88Q9BSF0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C2orf88Q9BSF0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C2orf88Q9BSF0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C2orf88Q9BSF0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C2orf88Q9BSF0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C2orf88Q9BSF0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C2orf88Q9BSF0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C2orf88Q9BSF0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C2orf88Q9BSF0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C2orf88Q9BSF0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C2orf88Q9BSF0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C2orf88Q9BSF0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C2orf88Q9BSF0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C2orf88Q9BSF0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C2orf88Q9BSF0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C2orf88Q9BSF0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C2orf88Q9BSF0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C2orf88Q9BSF0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C2orf88Q9BSF0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C2orf88Q9BSF0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C2orf88Q9BSF0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C2orf88Q9BSF0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C2orf88Q9BSF0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C2orf88Q9BSF0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C2orf88Q9BSF0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C2orf88Q9BSF0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C2orf88Q9BSF0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C2orf88Q9BSF0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C2orf88Q9BSF0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C2orf88Q9BSF0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C2orf88Q9BSF0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C2orf88Q9BSF0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C2orf88Q9BSF0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C2orf88Q9BSF0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C2orf88Q9BSF0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf88Q9BSF0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf88Q9BSF0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf88Q9BSF0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf88Q9BSF0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf88Q9BSF0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf88Q9BSF0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C2orf88Q9BSF0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf88Q9BSF0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf88Q9BSF0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf88Q9BSF0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf88Q9BSF0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf88Q9BSF0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf88Q9BSF0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf88Q9BSF0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf88Q9BSF0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf88Q9BSF0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C2orf88Q9BSF0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C2orf88Q9BSF0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C2orf88Q9BSF0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C2orf88Q9BSF0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C2orf88Q9BSF0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C2orf88Q9BSF0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C2orf88Q9BSF0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C2orf88Q9BSF0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C2orf88Q9BSF0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C2orf88Q9BSF0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C2orf88Q9BSF0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C2orf88Q9BSF0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C2orf88Q9BSF0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C2orf88Q9BSF0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C2orf88Q9BSF0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C2orf88Q9BSF0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C2orf88Q9BSF0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
C2orf88Q9BSF0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C2orf88Q9BSF0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C2orf88Q9BSF0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C2orf88Q9BSF0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C2orf88Q9BSF0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C2orf88Q9BSF0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C2orf88Q9BSF0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
C2orf88Q9BSF0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
C2orf88Q9BSF0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C2orf88Q9BSF0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C2orf88Q9BSF0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C2orf88Q9BSF0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C2orf88Q9BSF0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C2orf88Q9BSF0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C2orf88Q9BSF0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C2orf88Q9BSF0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C2orf88Q9BSF0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C2orf88Q9BSF0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C2orf88Q9BSF0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C2orf88Q9BSF0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C2orf88Q9BSF0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C2orf88Q9BSF0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
C2orf88Q9BSF0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C2orf88Q9BSF0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C2orf88Q9BSF0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C2orf88Q9BSF0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C2orf88Q9BSF0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C2orf88Q9BSF0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C2orf88Q9BSF0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C2orf88Q9BSF0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C2orf88Q9BSF0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms