Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TM2D3Q9BRN9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM2D3Q9BRN9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM2D3Q9BRN9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM2D3Q9BRN9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM2D3Q9BRN9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM2D3Q9BRN9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM2D3Q9BRN9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TM2D3Q9BRN9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TM2D3Q9BRN9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TM2D3Q9BRN9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TM2D3Q9BRN9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TM2D3Q9BRN9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TM2D3Q9BRN9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TM2D3Q9BRN9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TM2D3Q9BRN9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TM2D3Q9BRN9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TM2D3Q9BRN9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TM2D3Q9BRN9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TM2D3Q9BRN9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TM2D3Q9BRN9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TM2D3Q9BRN9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TM2D3Q9BRN9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TM2D3Q9BRN9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TM2D3Q9BRN9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TM2D3Q9BRN9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TM2D3Q9BRN9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TM2D3Q9BRN9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TM2D3Q9BRN9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TM2D3Q9BRN9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TM2D3Q9BRN9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TM2D3Q9BRN9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TM2D3Q9BRN9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TM2D3Q9BRN9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TM2D3Q9BRN9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TM2D3Q9BRN9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TM2D3Q9BRN9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TM2D3Q9BRN9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TM2D3Q9BRN9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TM2D3Q9BRN9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TM2D3Q9BRN9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TM2D3Q9BRN9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TM2D3Q9BRN9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TM2D3Q9BRN9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TM2D3Q9BRN9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TM2D3Q9BRN9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TM2D3Q9BRN9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TM2D3Q9BRN9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM2D3Q9BRN9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM2D3Q9BRN9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM2D3Q9BRN9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM2D3Q9BRN9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM2D3Q9BRN9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM2D3Q9BRN9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM2D3Q9BRN9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM2D3Q9BRN9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM2D3Q9BRN9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM2D3Q9BRN9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TM2D3Q9BRN9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TM2D3Q9BRN9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TM2D3Q9BRN9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TM2D3Q9BRN9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TM2D3Q9BRN9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TM2D3Q9BRN9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TM2D3Q9BRN9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TM2D3Q9BRN9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TM2D3Q9BRN9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM2D3Q9BRN9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM2D3Q9BRN9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM2D3Q9BRN9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM2D3Q9BRN9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM2D3Q9BRN9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM2D3Q9BRN9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TM2D3Q9BRN9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TM2D3Q9BRN9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TM2D3Q9BRN9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TM2D3Q9BRN9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TM2D3Q9BRN9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TM2D3Q9BRN9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TM2D3Q9BRN9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TM2D3Q9BRN9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TM2D3Q9BRN9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TM2D3Q9BRN9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TM2D3Q9BRN9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TM2D3Q9BRN9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TM2D3Q9BRN9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TM2D3Q9BRN9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TM2D3Q9BRN9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TM2D3Q9BRN9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TM2D3Q9BRN9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TM2D3Q9BRN9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TM2D3Q9BRN9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TM2D3Q9BRN9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TM2D3Q9BRN9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TM2D3Q9BRN9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TM2D3Q9BRN9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TM2D3Q9BRN9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TM2D3Q9BRN9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TM2D3Q9BRN9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TM2D3Q9BRN9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms