Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF8Q9BRL6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF8Q9BRL6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF8Q9BRL6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF8Q9BRL6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF8Q9BRL6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRSF8Q9BRL6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRSF8Q9BRL6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRSF8Q9BRL6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRSF8Q9BRL6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRSF8Q9BRL6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF8Q9BRL6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF8Q9BRL6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF8Q9BRL6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF8Q9BRL6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF8Q9BRL6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF8Q9BRL6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF8Q9BRL6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF8Q9BRL6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF8Q9BRL6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF8Q9BRL6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF8Q9BRL6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF8Q9BRL6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF8Q9BRL6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF8Q9BRL6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF8Q9BRL6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF8Q9BRL6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF8Q9BRL6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF8Q9BRL6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF8Q9BRL6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF8Q9BRL6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF8Q9BRL6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF8Q9BRL6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF8Q9BRL6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF8Q9BRL6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF8Q9BRL6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF8Q9BRL6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF8Q9BRL6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF8Q9BRL6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF8Q9BRL6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF8Q9BRL6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF8Q9BRL6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF8Q9BRL6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF8Q9BRL6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF8Q9BRL6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF8Q9BRL6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF8Q9BRL6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF8Q9BRL6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF8Q9BRL6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF8Q9BRL6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF8Q9BRL6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF8Q9BRL6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF8Q9BRL6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF8Q9BRL6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF8Q9BRL6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF8Q9BRL6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF8Q9BRL6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF8Q9BRL6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF8Q9BRL6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SRSF8Q9BRL6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF8Q9BRL6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF8Q9BRL6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF8Q9BRL6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF8Q9BRL6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF8Q9BRL6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF8Q9BRL6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF8Q9BRL6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF8Q9BRL6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF8Q9BRL6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF8Q9BRL6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF8Q9BRL6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF8Q9BRL6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF8Q9BRL6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF8Q9BRL6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF8Q9BRL6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF8Q9BRL6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF8Q9BRL6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF8Q9BRL6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF8Q9BRL6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF8Q9BRL6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF8Q9BRL6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF8Q9BRL6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF8Q9BRL6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF8Q9BRL6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF8Q9BRL6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF8Q9BRL6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF8Q9BRL6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF8Q9BRL6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF8Q9BRL6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF8Q9BRL6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF8Q9BRL6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF8Q9BRL6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF8Q9BRL6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF8Q9BRL6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF8Q9BRL6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF8Q9BRL6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF8Q9BRL6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF8Q9BRL6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF8Q9BRL6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF8Q9BRL6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 367.8 ms