Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF559Q9BR84 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF559Q9BR84 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF559Q9BR84 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF559Q9BR84 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF559Q9BR84 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF559Q9BR84 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF559Q9BR84 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF559Q9BR84 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF559Q9BR84 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF559Q9BR84 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF559Q9BR84 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF559Q9BR84 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF559Q9BR84 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF559Q9BR84 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF559Q9BR84 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF559Q9BR84 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF559Q9BR84 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF559Q9BR84 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF559Q9BR84 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF559Q9BR84 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF559Q9BR84 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF559Q9BR84 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF559Q9BR84 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF559Q9BR84 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF559Q9BR84 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF559Q9BR84 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF559Q9BR84 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF559Q9BR84 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF559Q9BR84 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF559Q9BR84 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF559Q9BR84 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF559Q9BR84 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF559Q9BR84 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF559Q9BR84 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF559Q9BR84 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF559Q9BR84 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF559Q9BR84 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF559Q9BR84 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF559Q9BR84 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF559Q9BR84 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF559Q9BR84 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF559Q9BR84 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF559Q9BR84 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF559Q9BR84 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF559Q9BR84 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF559Q9BR84 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF559Q9BR84 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF559Q9BR84 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF559Q9BR84 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF559Q9BR84 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF559Q9BR84 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF559Q9BR84 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF559Q9BR84 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF559Q9BR84 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF559Q9BR84 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF559Q9BR84 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF559Q9BR84 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF559Q9BR84 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF559Q9BR84 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF559Q9BR84 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF559Q9BR84 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF559Q9BR84 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF559Q9BR84 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF559Q9BR84 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF559Q9BR84 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF559Q9BR84 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF559Q9BR84 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF559Q9BR84 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF559Q9BR84 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF559Q9BR84 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF559Q9BR84 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF559Q9BR84 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF559Q9BR84 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF559Q9BR84 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF559Q9BR84 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF559Q9BR84 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF559Q9BR84 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF559Q9BR84 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF559Q9BR84 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF559Q9BR84 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF559Q9BR84 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF559Q9BR84 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF559Q9BR84 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF559Q9BR84 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF559Q9BR84 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF559Q9BR84 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF559Q9BR84 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF559Q9BR84 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF559Q9BR84 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF559Q9BR84 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF559Q9BR84 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF559Q9BR84 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF559Q9BR84 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF559Q9BR84 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF559Q9BR84 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF559Q9BR84 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF559Q9BR84 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF559Q9BR84 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF559Q9BR84 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms