Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CITED1Q99966 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CITED1Q99966 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CITED1Q99966 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CITED1Q99966 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CITED1Q99966 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CITED1Q99966 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CITED1Q99966 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CITED1Q99966 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CITED1Q99966 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CITED1Q99966 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CITED1Q99966 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CITED1Q99966 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CITED1Q99966 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CITED1Q99966 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CITED1Q99966 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CITED1Q99966 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CITED1Q99966 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CITED1Q99966 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CITED1Q99966 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CITED1Q99966 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CITED1Q99966 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CITED1Q99966 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CITED1Q99966 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CITED1Q99966 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CITED1Q99966 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CITED1Q99966 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CITED1Q99966 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CITED1Q99966 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CITED1Q99966 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CITED1Q99966 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CITED1Q99966 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CITED1Q99966 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CITED1Q99966 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CITED1Q99966 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CITED1Q99966 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CITED1Q99966 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CITED1Q99966 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CITED1Q99966 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CITED1Q99966 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CITED1Q99966 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CITED1Q99966 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CITED1Q99966 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CITED1Q99966 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CITED1Q99966 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CITED1Q99966 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CITED1Q99966 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CITED1Q99966 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CITED1Q99966 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CITED1Q99966 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CITED1Q99966 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CITED1Q99966 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CITED1Q99966 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CITED1Q99966 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CITED1Q99966 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CITED1Q99966 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CITED1Q99966 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CITED1Q99966 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CITED1Q99966 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CITED1Q99966 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CITED1Q99966 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CITED1Q99966 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CITED1Q99966 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CITED1Q99966 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CITED1Q99966 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CITED1Q99966 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CITED1Q99966 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CITED1Q99966 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CITED1Q99966 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CITED1Q99966 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CITED1Q99966 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CITED1Q99966 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CITED1Q99966 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CITED1Q99966 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CITED1Q99966 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CITED1Q99966 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CITED1Q99966 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CITED1Q99966 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CITED1Q99966 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CITED1Q99966 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CITED1Q99966 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CITED1Q99966 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CITED1Q99966 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CITED1Q99966 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CITED1Q99966 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CITED1Q99966 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CITED1Q99966 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CITED1Q99966 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CITED1Q99966 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CITED1Q99966 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CITED1Q99966 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CITED1Q99966 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CITED1Q99966 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CITED1Q99966 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CITED1Q99966 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CITED1Q99966 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CITED1Q99966 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CITED1Q99966 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CITED1Q99966 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CITED1Q99966 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms