Protein–RNA interactions for Protein: Q99576

TSC22D3, TSC22 domain family protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC22D3Q99576 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSC22D3Q99576 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSC22D3Q99576 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSC22D3Q99576 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSC22D3Q99576 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSC22D3Q99576 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSC22D3Q99576 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSC22D3Q99576 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSC22D3Q99576 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSC22D3Q99576 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSC22D3Q99576 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSC22D3Q99576 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSC22D3Q99576 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSC22D3Q99576 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TSC22D3Q99576 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TSC22D3Q99576 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TSC22D3Q99576 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSC22D3Q99576 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSC22D3Q99576 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSC22D3Q99576 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSC22D3Q99576 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TSC22D3Q99576 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSC22D3Q99576 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSC22D3Q99576 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSC22D3Q99576 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TSC22D3Q99576 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSC22D3Q99576 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSC22D3Q99576 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSC22D3Q99576 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSC22D3Q99576 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TSC22D3Q99576 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSC22D3Q99576 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSC22D3Q99576 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSC22D3Q99576 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSC22D3Q99576 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSC22D3Q99576 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSC22D3Q99576 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSC22D3Q99576 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSC22D3Q99576 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSC22D3Q99576 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSC22D3Q99576 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSC22D3Q99576 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSC22D3Q99576 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSC22D3Q99576 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSC22D3Q99576 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSC22D3Q99576 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSC22D3Q99576 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSC22D3Q99576 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSC22D3Q99576 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSC22D3Q99576 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSC22D3Q99576 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSC22D3Q99576 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSC22D3Q99576 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSC22D3Q99576 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSC22D3Q99576 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSC22D3Q99576 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TSC22D3Q99576 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSC22D3Q99576 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSC22D3Q99576 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSC22D3Q99576 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSC22D3Q99576 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSC22D3Q99576 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSC22D3Q99576 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSC22D3Q99576 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSC22D3Q99576 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSC22D3Q99576 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSC22D3Q99576 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSC22D3Q99576 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSC22D3Q99576 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSC22D3Q99576 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSC22D3Q99576 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSC22D3Q99576 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSC22D3Q99576 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSC22D3Q99576 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSC22D3Q99576 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSC22D3Q99576 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSC22D3Q99576 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSC22D3Q99576 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TSC22D3Q99576 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSC22D3Q99576 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSC22D3Q99576 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSC22D3Q99576 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSC22D3Q99576 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSC22D3Q99576 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSC22D3Q99576 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSC22D3Q99576 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSC22D3Q99576 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSC22D3Q99576 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSC22D3Q99576 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSC22D3Q99576 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSC22D3Q99576 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSC22D3Q99576 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSC22D3Q99576 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSC22D3Q99576 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSC22D3Q99576 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSC22D3Q99576 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSC22D3Q99576 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSC22D3Q99576 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSC22D3Q99576 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TSC22D3Q99576 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms