Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYCBPQ99417 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYCBPQ99417 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYCBPQ99417 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYCBPQ99417 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYCBPQ99417 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYCBPQ99417 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYCBPQ99417 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYCBPQ99417 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYCBPQ99417 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYCBPQ99417 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MYCBPQ99417 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYCBPQ99417 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYCBPQ99417 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYCBPQ99417 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYCBPQ99417 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYCBPQ99417 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYCBPQ99417 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYCBPQ99417 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MYCBPQ99417 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYCBPQ99417 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYCBPQ99417 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYCBPQ99417 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYCBPQ99417 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYCBPQ99417 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYCBPQ99417 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYCBPQ99417 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYCBPQ99417 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYCBPQ99417 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYCBPQ99417 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYCBPQ99417 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYCBPQ99417 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYCBPQ99417 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYCBPQ99417 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYCBPQ99417 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYCBPQ99417 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYCBPQ99417 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYCBPQ99417 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYCBPQ99417 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYCBPQ99417 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYCBPQ99417 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYCBPQ99417 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYCBPQ99417 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYCBPQ99417 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYCBPQ99417 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYCBPQ99417 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYCBPQ99417 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYCBPQ99417 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MYCBPQ99417 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MYCBPQ99417 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MYCBPQ99417 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MYCBPQ99417 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MYCBPQ99417 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYCBPQ99417 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYCBPQ99417 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYCBPQ99417 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYCBPQ99417 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MYCBPQ99417 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYCBPQ99417 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYCBPQ99417 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYCBPQ99417 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYCBPQ99417 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYCBPQ99417 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYCBPQ99417 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYCBPQ99417 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYCBPQ99417 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYCBPQ99417 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYCBPQ99417 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYCBPQ99417 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MYCBPQ99417 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYCBPQ99417 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYCBPQ99417 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYCBPQ99417 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYCBPQ99417 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYCBPQ99417 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYCBPQ99417 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYCBPQ99417 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYCBPQ99417 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYCBPQ99417 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYCBPQ99417 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYCBPQ99417 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MYCBPQ99417 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYCBPQ99417 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYCBPQ99417 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYCBPQ99417 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYCBPQ99417 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYCBPQ99417 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MYCBPQ99417 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYCBPQ99417 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
MYCBPQ99417 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYCBPQ99417 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYCBPQ99417 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYCBPQ99417 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYCBPQ99417 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYCBPQ99417 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYCBPQ99417 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYCBPQ99417 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYCBPQ99417 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYCBPQ99417 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYCBPQ99417 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms