Protein–RNA interactions for Protein: Q96S86

HAPLN3, Hyaluronan and proteoglycan link protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN3Q96S86 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HAPLN3Q96S86 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HAPLN3Q96S86 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HAPLN3Q96S86 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HAPLN3Q96S86 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HAPLN3Q96S86 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HAPLN3Q96S86 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HAPLN3Q96S86 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HAPLN3Q96S86 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HAPLN3Q96S86 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HAPLN3Q96S86 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HAPLN3Q96S86 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HAPLN3Q96S86 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HAPLN3Q96S86 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HAPLN3Q96S86 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HAPLN3Q96S86 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HAPLN3Q96S86 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HAPLN3Q96S86 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HAPLN3Q96S86 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HAPLN3Q96S86 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HAPLN3Q96S86 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HAPLN3Q96S86 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HAPLN3Q96S86 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HAPLN3Q96S86 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HAPLN3Q96S86 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HAPLN3Q96S86 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HAPLN3Q96S86 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HAPLN3Q96S86 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HAPLN3Q96S86 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HAPLN3Q96S86 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HAPLN3Q96S86 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HAPLN3Q96S86 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HAPLN3Q96S86 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HAPLN3Q96S86 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HAPLN3Q96S86 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HAPLN3Q96S86 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HAPLN3Q96S86 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HAPLN3Q96S86 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HAPLN3Q96S86 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HAPLN3Q96S86 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HAPLN3Q96S86 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HAPLN3Q96S86 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HAPLN3Q96S86 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HAPLN3Q96S86 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HAPLN3Q96S86 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HAPLN3Q96S86 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HAPLN3Q96S86 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HAPLN3Q96S86 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HAPLN3Q96S86 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HAPLN3Q96S86 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HAPLN3Q96S86 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HAPLN3Q96S86 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HAPLN3Q96S86 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HAPLN3Q96S86 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HAPLN3Q96S86 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HAPLN3Q96S86 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HAPLN3Q96S86 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HAPLN3Q96S86 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HAPLN3Q96S86 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HAPLN3Q96S86 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HAPLN3Q96S86 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HAPLN3Q96S86 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HAPLN3Q96S86 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HAPLN3Q96S86 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HAPLN3Q96S86 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HAPLN3Q96S86 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HAPLN3Q96S86 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HAPLN3Q96S86 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HAPLN3Q96S86 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HAPLN3Q96S86 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HAPLN3Q96S86 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HAPLN3Q96S86 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HAPLN3Q96S86 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HAPLN3Q96S86 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HAPLN3Q96S86 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HAPLN3Q96S86 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HAPLN3Q96S86 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HAPLN3Q96S86 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HAPLN3Q96S86 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HAPLN3Q96S86 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HAPLN3Q96S86 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HAPLN3Q96S86 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HAPLN3Q96S86 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HAPLN3Q96S86 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
HAPLN3Q96S86 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HAPLN3Q96S86 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HAPLN3Q96S86 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HAPLN3Q96S86 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HAPLN3Q96S86 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HAPLN3Q96S86 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HAPLN3Q96S86 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HAPLN3Q96S86 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HAPLN3Q96S86 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HAPLN3Q96S86 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HAPLN3Q96S86 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HAPLN3Q96S86 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HAPLN3Q96S86 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HAPLN3Q96S86 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HAPLN3Q96S86 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HAPLN3Q96S86 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms