Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ3

MCCC1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC1Q96RQ3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCCC1Q96RQ3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MCCC1Q96RQ3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCCC1Q96RQ3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCCC1Q96RQ3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCCC1Q96RQ3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MCCC1Q96RQ3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCCC1Q96RQ3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCCC1Q96RQ3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCCC1Q96RQ3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCCC1Q96RQ3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCCC1Q96RQ3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCCC1Q96RQ3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCCC1Q96RQ3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCCC1Q96RQ3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCCC1Q96RQ3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCCC1Q96RQ3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MCCC1Q96RQ3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCCC1Q96RQ3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCCC1Q96RQ3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCCC1Q96RQ3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCCC1Q96RQ3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCCC1Q96RQ3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MCCC1Q96RQ3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCCC1Q96RQ3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCCC1Q96RQ3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCCC1Q96RQ3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCCC1Q96RQ3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCCC1Q96RQ3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCCC1Q96RQ3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCCC1Q96RQ3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MCCC1Q96RQ3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCCC1Q96RQ3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCCC1Q96RQ3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCCC1Q96RQ3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCCC1Q96RQ3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCCC1Q96RQ3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCCC1Q96RQ3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCCC1Q96RQ3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCCC1Q96RQ3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCCC1Q96RQ3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCCC1Q96RQ3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCCC1Q96RQ3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCCC1Q96RQ3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCCC1Q96RQ3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCCC1Q96RQ3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCCC1Q96RQ3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MCCC1Q96RQ3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MCCC1Q96RQ3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCCC1Q96RQ3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCCC1Q96RQ3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCCC1Q96RQ3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCCC1Q96RQ3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCCC1Q96RQ3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCCC1Q96RQ3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MCCC1Q96RQ3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCCC1Q96RQ3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCCC1Q96RQ3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCCC1Q96RQ3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCCC1Q96RQ3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCCC1Q96RQ3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MCCC1Q96RQ3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCCC1Q96RQ3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCCC1Q96RQ3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCCC1Q96RQ3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCCC1Q96RQ3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCCC1Q96RQ3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCCC1Q96RQ3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCCC1Q96RQ3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCCC1Q96RQ3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCCC1Q96RQ3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCCC1Q96RQ3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCCC1Q96RQ3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCCC1Q96RQ3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCCC1Q96RQ3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCCC1Q96RQ3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCCC1Q96RQ3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCCC1Q96RQ3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCCC1Q96RQ3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MCCC1Q96RQ3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MCCC1Q96RQ3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MCCC1Q96RQ3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCCC1Q96RQ3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCCC1Q96RQ3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCCC1Q96RQ3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCCC1Q96RQ3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCCC1Q96RQ3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCCC1Q96RQ3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCCC1Q96RQ3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCCC1Q96RQ3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCCC1Q96RQ3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCCC1Q96RQ3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCCC1Q96RQ3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCCC1Q96RQ3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCCC1Q96RQ3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCCC1Q96RQ3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCCC1Q96RQ3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCCC1Q96RQ3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCCC1Q96RQ3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCCC1Q96RQ3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms