Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU5

NEDD4L, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4LQ96PU5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD4LQ96PU5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD4LQ96PU5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD4LQ96PU5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD4LQ96PU5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD4LQ96PU5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD4LQ96PU5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD4LQ96PU5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD4LQ96PU5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD4LQ96PU5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD4LQ96PU5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD4LQ96PU5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD4LQ96PU5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD4LQ96PU5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD4LQ96PU5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD4LQ96PU5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD4LQ96PU5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD4LQ96PU5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD4LQ96PU5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD4LQ96PU5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD4LQ96PU5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD4LQ96PU5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD4LQ96PU5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD4LQ96PU5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD4LQ96PU5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD4LQ96PU5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD4LQ96PU5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD4LQ96PU5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD4LQ96PU5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NEDD4LQ96PU5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD4LQ96PU5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NEDD4LQ96PU5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD4LQ96PU5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD4LQ96PU5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD4LQ96PU5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD4LQ96PU5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD4LQ96PU5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD4LQ96PU5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NEDD4LQ96PU5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD4LQ96PU5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD4LQ96PU5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD4LQ96PU5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NEDD4LQ96PU5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD4LQ96PU5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD4LQ96PU5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD4LQ96PU5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD4LQ96PU5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD4LQ96PU5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD4LQ96PU5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD4LQ96PU5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD4LQ96PU5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD4LQ96PU5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD4LQ96PU5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD4LQ96PU5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD4LQ96PU5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD4LQ96PU5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NEDD4LQ96PU5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD4LQ96PU5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD4LQ96PU5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD4LQ96PU5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD4LQ96PU5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD4LQ96PU5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD4LQ96PU5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NEDD4LQ96PU5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD4LQ96PU5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD4LQ96PU5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD4LQ96PU5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD4LQ96PU5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD4LQ96PU5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEDD4LQ96PU5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEDD4LQ96PU5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEDD4LQ96PU5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NEDD4LQ96PU5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NEDD4LQ96PU5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD4LQ96PU5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD4LQ96PU5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD4LQ96PU5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD4LQ96PU5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD4LQ96PU5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD4LQ96PU5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD4LQ96PU5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD4LQ96PU5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD4LQ96PU5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD4LQ96PU5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD4LQ96PU5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD4LQ96PU5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD4LQ96PU5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD4LQ96PU5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD4LQ96PU5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD4LQ96PU5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD4LQ96PU5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD4LQ96PU5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD4LQ96PU5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD4LQ96PU5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD4LQ96PU5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD4LQ96PU5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD4LQ96PU5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD4LQ96PU5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD4LQ96PU5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD4LQ96PU5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms