Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NLRP3Q96P20 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NLRP3Q96P20 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NLRP3Q96P20 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
NLRP3Q96P20 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NLRP3Q96P20 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NLRP3Q96P20 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NLRP3Q96P20 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
NLRP3Q96P20 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
NLRP3Q96P20 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
NLRP3Q96P20 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
NLRP3Q96P20 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NLRP3Q96P20 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NLRP3Q96P20 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NLRP3Q96P20 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NLRP3Q96P20 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
NLRP3Q96P20 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NLRP3Q96P20 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NLRP3Q96P20 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NLRP3Q96P20 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NLRP3Q96P20 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NLRP3Q96P20 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NLRP3Q96P20 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NLRP3Q96P20 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NLRP3Q96P20 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NLRP3Q96P20 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NLRP3Q96P20 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NLRP3Q96P20 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NLRP3Q96P20 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NLRP3Q96P20 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NLRP3Q96P20 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NLRP3Q96P20 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NLRP3Q96P20 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NLRP3Q96P20 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NLRP3Q96P20 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NLRP3Q96P20 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NLRP3Q96P20 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NLRP3Q96P20 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NLRP3Q96P20 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
NLRP3Q96P20 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
NLRP3Q96P20 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NLRP3Q96P20 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NLRP3Q96P20 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NLRP3Q96P20 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
NLRP3Q96P20 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
NLRP3Q96P20 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NLRP3Q96P20 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NLRP3Q96P20 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NLRP3Q96P20 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NLRP3Q96P20 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NLRP3Q96P20 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NLRP3Q96P20 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NLRP3Q96P20 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NLRP3Q96P20 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NLRP3Q96P20 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NLRP3Q96P20 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NLRP3Q96P20 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NLRP3Q96P20 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
NLRP3Q96P20 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NLRP3Q96P20 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NLRP3Q96P20 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NLRP3Q96P20 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NLRP3Q96P20 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NLRP3Q96P20 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NLRP3Q96P20 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NLRP3Q96P20 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NLRP3Q96P20 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NLRP3Q96P20 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
NLRP3Q96P20 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NLRP3Q96P20 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NLRP3Q96P20 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NLRP3Q96P20 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NLRP3Q96P20 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NLRP3Q96P20 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
NLRP3Q96P20 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NLRP3Q96P20 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NLRP3Q96P20 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NLRP3Q96P20 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NLRP3Q96P20 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
NLRP3Q96P20 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NLRP3Q96P20 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NLRP3Q96P20 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NLRP3Q96P20 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
NLRP3Q96P20 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NLRP3Q96P20 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NLRP3Q96P20 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NLRP3Q96P20 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NLRP3Q96P20 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NLRP3Q96P20 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NLRP3Q96P20 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NLRP3Q96P20 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NLRP3Q96P20 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NLRP3Q96P20 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NLRP3Q96P20 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NLRP3Q96P20 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NLRP3Q96P20 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NLRP3Q96P20 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NLRP3Q96P20 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NLRP3Q96P20 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NLRP3Q96P20 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms