Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCLT1Q96NL6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCLT1Q96NL6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCLT1Q96NL6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCLT1Q96NL6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCLT1Q96NL6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCLT1Q96NL6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCLT1Q96NL6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCLT1Q96NL6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCLT1Q96NL6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCLT1Q96NL6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCLT1Q96NL6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCLT1Q96NL6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCLT1Q96NL6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCLT1Q96NL6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCLT1Q96NL6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCLT1Q96NL6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCLT1Q96NL6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCLT1Q96NL6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCLT1Q96NL6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCLT1Q96NL6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCLT1Q96NL6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCLT1Q96NL6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCLT1Q96NL6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCLT1Q96NL6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCLT1Q96NL6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SCLT1Q96NL6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SCLT1Q96NL6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCLT1Q96NL6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCLT1Q96NL6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCLT1Q96NL6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCLT1Q96NL6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCLT1Q96NL6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCLT1Q96NL6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCLT1Q96NL6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SCLT1Q96NL6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCLT1Q96NL6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCLT1Q96NL6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCLT1Q96NL6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCLT1Q96NL6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCLT1Q96NL6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SCLT1Q96NL6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SCLT1Q96NL6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCLT1Q96NL6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SCLT1Q96NL6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCLT1Q96NL6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCLT1Q96NL6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCLT1Q96NL6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCLT1Q96NL6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCLT1Q96NL6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCLT1Q96NL6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SCLT1Q96NL6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SCLT1Q96NL6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCLT1Q96NL6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCLT1Q96NL6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SCLT1Q96NL6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCLT1Q96NL6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCLT1Q96NL6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCLT1Q96NL6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCLT1Q96NL6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCLT1Q96NL6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCLT1Q96NL6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SCLT1Q96NL6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCLT1Q96NL6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCLT1Q96NL6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCLT1Q96NL6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCLT1Q96NL6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCLT1Q96NL6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCLT1Q96NL6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCLT1Q96NL6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCLT1Q96NL6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCLT1Q96NL6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SCLT1Q96NL6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCLT1Q96NL6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCLT1Q96NL6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCLT1Q96NL6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCLT1Q96NL6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCLT1Q96NL6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCLT1Q96NL6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCLT1Q96NL6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCLT1Q96NL6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCLT1Q96NL6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCLT1Q96NL6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCLT1Q96NL6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SCLT1Q96NL6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCLT1Q96NL6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCLT1Q96NL6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCLT1Q96NL6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCLT1Q96NL6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SCLT1Q96NL6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCLT1Q96NL6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCLT1Q96NL6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCLT1Q96NL6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCLT1Q96NL6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCLT1Q96NL6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCLT1Q96NL6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCLT1Q96NL6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCLT1Q96NL6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCLT1Q96NL6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCLT1Q96NL6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms