Protein–RNA interactions for Protein: Q96NB2

SFXN2, Sideroflexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN2Q96NB2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFXN2Q96NB2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFXN2Q96NB2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFXN2Q96NB2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFXN2Q96NB2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFXN2Q96NB2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFXN2Q96NB2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFXN2Q96NB2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFXN2Q96NB2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SFXN2Q96NB2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFXN2Q96NB2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFXN2Q96NB2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFXN2Q96NB2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFXN2Q96NB2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFXN2Q96NB2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SFXN2Q96NB2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFXN2Q96NB2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFXN2Q96NB2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SFXN2Q96NB2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SFXN2Q96NB2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SFXN2Q96NB2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFXN2Q96NB2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFXN2Q96NB2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFXN2Q96NB2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFXN2Q96NB2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFXN2Q96NB2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFXN2Q96NB2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SFXN2Q96NB2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFXN2Q96NB2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFXN2Q96NB2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFXN2Q96NB2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFXN2Q96NB2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFXN2Q96NB2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFXN2Q96NB2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFXN2Q96NB2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFXN2Q96NB2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFXN2Q96NB2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFXN2Q96NB2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SFXN2Q96NB2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SFXN2Q96NB2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFXN2Q96NB2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFXN2Q96NB2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFXN2Q96NB2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SFXN2Q96NB2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFXN2Q96NB2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFXN2Q96NB2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFXN2Q96NB2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFXN2Q96NB2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFXN2Q96NB2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFXN2Q96NB2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFXN2Q96NB2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFXN2Q96NB2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFXN2Q96NB2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFXN2Q96NB2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFXN2Q96NB2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFXN2Q96NB2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFXN2Q96NB2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFXN2Q96NB2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFXN2Q96NB2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFXN2Q96NB2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFXN2Q96NB2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFXN2Q96NB2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SFXN2Q96NB2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFXN2Q96NB2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFXN2Q96NB2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFXN2Q96NB2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFXN2Q96NB2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SFXN2Q96NB2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SFXN2Q96NB2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFXN2Q96NB2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFXN2Q96NB2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SFXN2Q96NB2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SFXN2Q96NB2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFXN2Q96NB2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFXN2Q96NB2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFXN2Q96NB2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFXN2Q96NB2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFXN2Q96NB2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFXN2Q96NB2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFXN2Q96NB2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFXN2Q96NB2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFXN2Q96NB2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFXN2Q96NB2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFXN2Q96NB2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFXN2Q96NB2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFXN2Q96NB2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFXN2Q96NB2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SFXN2Q96NB2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFXN2Q96NB2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFXN2Q96NB2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFXN2Q96NB2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFXN2Q96NB2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFXN2Q96NB2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFXN2Q96NB2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFXN2Q96NB2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFXN2Q96NB2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFXN2Q96NB2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFXN2Q96NB2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFXN2Q96NB2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFXN2Q96NB2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms